224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1481 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  63.57 
 
 
306 aa  373  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  52.03 
 
 
307 aa  276  3e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  51.38 
 
 
302 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.49 
 
 
301 aa  267  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  50.7 
 
 
292 aa  253  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  36.91 
 
 
301 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  36.63 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  36.36 
 
 
303 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  36.36 
 
 
301 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  36.36 
 
 
303 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  36.36 
 
 
303 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  36.36 
 
 
303 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  36.36 
 
 
303 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  36.36 
 
 
303 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  36.36 
 
 
303 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  35.91 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  38.11 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  39.1 
 
 
292 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.9 
 
 
312 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.38 
 
 
308 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  35.92 
 
 
319 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.44 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 
293 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  34.35 
 
 
298 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.69 
 
 
302 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  34.27 
 
 
293 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  36.99 
 
 
296 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  33.81 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  36.55 
 
 
300 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  30.82 
 
 
288 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  30.82 
 
 
288 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.32 
 
 
252 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  31.6 
 
 
295 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  31.14 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 
343 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.88 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  32.12 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  29.35 
 
 
300 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  32.1 
 
 
288 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
290 aa  116  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  30.69 
 
 
322 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
308 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.42 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.06 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
297 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 
290 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  34.64 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  31.27 
 
 
301 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  30.58 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  31.15 
 
 
309 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  32.07 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.69 
 
 
295 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 
304 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  32.67 
 
 
308 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  28.42 
 
 
299 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 
301 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  31.91 
 
 
299 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  28.32 
 
 
305 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  29.68 
 
 
307 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  30.71 
 
 
305 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  29.3 
 
 
304 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 
297 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  28.04 
 
 
296 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  30.5 
 
 
308 aa  103  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
294 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  28.22 
 
 
312 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  27.12 
 
 
310 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  30.29 
 
 
292 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  29.71 
 
 
305 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  27.53 
 
 
311 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  28.23 
 
 
307 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  31.6 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  29.56 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  26.83 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  27.21 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  27.46 
 
 
316 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  30.66 
 
 
316 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  30.25 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  27.08 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  25.25 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
295 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  30.14 
 
 
295 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  29.79 
 
 
295 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  29.82 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  31.8 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  31.58 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  28.22 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  30.58 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>