81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0557 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 		 195 aa  372  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  68.91 
 
 		 194 aa  240  7.999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  56.92 
 
 		 193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  42.86 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000920884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  38.78 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  37.44 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  41.33 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  38.07 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.9 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  37.24 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  36.73 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000465772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  39.29 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.69 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.41 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  0.00000105881 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.5 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  35.38 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  35.38 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.71 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  38.38 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  39.29 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  40.35 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  36.36 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  33.64 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  37.44 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  42.48 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  31.28 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.8 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.7 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.57 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.23 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  39.47 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.21 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.32 
 
 		 299 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.31 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2305  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.86 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.31 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.15 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.15 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.15 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  28.97 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.57 
 
 		 310 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.61 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.23 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.61 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  33.93 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.43 
 
 		 328 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27 
 
 		 310 aa  48.5  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  35.04 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.53 
 
 		 307 aa  48.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  28.24 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  34.19 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.86 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  31.25 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  36.75 
 
 		 339 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.71 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  35.56 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  29.3 
 
 		 256 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  27.14 
 
 		 235 aa  45.1  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  31.3 
 
 		 330 aa  44.7  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.09 
 
 		 230 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  31.85 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  27.48 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2801  ABC type permease  35.78 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.11 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.96 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.17 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  34.07 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1929  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  25.81 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  26.76 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  27.98 
 
 		 599 aa  42.4  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0712  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.67 
 
 		 332 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.218257  hitchhiker  0.00000357899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  29.3 
 
 		 321 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  27.23 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  25.35 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  23.72 
 
 		 235 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  33.94 
 
 		 352 aa  41.6  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  28.11 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  31.52 
 
 		 246 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  28.11 
 
 		 226 aa  41.2  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.1 
 
 		 250 aa  41.2  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>