84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0156 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  100 
 
 
206 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  83.01 
 
 
203 aa  283  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  73.78 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  62.72 
 
 
221 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  62.87 
 
 
211 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  62.87 
 
 
221 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  62.87 
 
 
221 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  62.87 
 
 
211 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  62.87 
 
 
221 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  63.64 
 
 
188 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  62.2 
 
 
164 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  56.98 
 
 
224 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  63.06 
 
 
187 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  63.29 
 
 
186 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  61.35 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  63.69 
 
 
180 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  58.28 
 
 
193 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  58.28 
 
 
193 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.48 
 
 
149 aa  84.7  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.24 
 
 
186 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.94 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.21 
 
 
136 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  48.24 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4177  flagellar biosynthesis protein FliO  43.65 
 
 
162 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  31.51 
 
 
140 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  33.56 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  48.68 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1354  flagellar biosynthesis protein, FliO  48.19 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  42.17 
 
 
153 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  34.96 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  43.55 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.36 
 
 
149 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.07 
 
 
163 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  34.21 
 
 
146 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1609  flagellar biogenesis protein FliO  41 
 
 
144 aa  61.6  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796817  normal  0.163037 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  32.06 
 
 
130 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  33.77 
 
 
144 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.36 
 
 
146 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  35.48 
 
 
159 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  29.66 
 
 
151 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  36.67 
 
 
125 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  36.67 
 
 
125 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  36.67 
 
 
125 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  36.67 
 
 
125 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  36.67 
 
 
125 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  31.3 
 
 
127 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  31.3 
 
 
127 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  46.55 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  46.55 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  31.62 
 
 
150 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  38.14 
 
 
124 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.58 
 
 
125 aa  54.7  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.78 
 
 
136 aa  54.7  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.71 
 
 
125 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  25.44 
 
 
133 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  39.29 
 
 
138 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  30.97 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1969  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.76 
 
 
142 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.152772  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  28.97 
 
 
124 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  26.62 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.21 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  27.47 
 
 
136 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  29.51 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.51 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  30 
 
 
166 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1446  flagellar biosynthesis protein FliO  37.5 
 
 
142 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00843701  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2927  flagellar biosynthesis protein FliO  37.5 
 
 
140 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  23.81 
 
 
127 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2917  flagellar biosynthesis protein FliO  37.5 
 
 
141 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21495  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1351  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.5 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00422095  normal  0.37669 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  24.03 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1291  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.5 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1358  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.5 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  29.51 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0977  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.9 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.40867  normal  0.0426342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  26.51 
 
 
124 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.62 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3219  flagellar protein FliO  37.5 
 
 
135 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3059  flagellar biosynthesis protein FliO  35.71 
 
 
142 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.400554  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  40.32 
 
 
139 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2567  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.71 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.72 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  29.87 
 
 
114 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>