More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4850 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  100 
 
 
300 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  66.31 
 
 
287 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  63.93 
 
 
291 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  64.52 
 
 
285 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  61.84 
 
 
293 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  60.5 
 
 
286 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  61.97 
 
 
295 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  59.5 
 
 
298 aa  355  5.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  47.31 
 
 
286 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
305 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  26.95 
 
 
276 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
307 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 
306 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  29.02 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  27.64 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  33.45 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  29.96 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  30.22 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 
283 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.22 
 
 
285 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  30.36 
 
 
273 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 
289 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  32.88 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  30.45 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
297 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 
321 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 
280 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  30.22 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  29.35 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  30.14 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  29 
 
 
279 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  29.24 
 
 
610 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  32.52 
 
 
286 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  31.51 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  28.99 
 
 
271 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  29.31 
 
 
288 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  31.74 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  30.99 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  32.45 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  30.34 
 
 
286 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.93 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  28.47 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  31.38 
 
 
301 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 
283 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  29.27 
 
 
280 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.44 
 
 
284 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  32.05 
 
 
310 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  31.74 
 
 
289 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  31.74 
 
 
289 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  29.58 
 
 
279 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  31.74 
 
 
289 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.74 
 
 
289 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  31.74 
 
 
289 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  31.74 
 
 
289 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.74 
 
 
289 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.38 
 
 
613 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
291 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  28.07 
 
 
277 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  28.07 
 
 
277 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  28.07 
 
 
277 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  29.43 
 
 
290 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  29.96 
 
 
296 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  28.93 
 
 
283 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  29.21 
 
 
288 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  29.93 
 
 
281 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  30.88 
 
 
297 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  28.01 
 
 
269 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  30.1 
 
 
293 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  30.1 
 
 
293 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  29.23 
 
 
288 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  28.47 
 
 
277 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  28.47 
 
 
277 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  26.16 
 
 
270 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  29.43 
 
 
288 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  29.89 
 
 
279 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.5 
 
 
299 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  27.3 
 
 
366 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  33.1 
 
 
283 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  30.66 
 
 
304 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 
281 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  30.24 
 
 
284 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  28.78 
 
 
269 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  27.7 
 
 
269 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 
305 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 
308 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 
290 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  27.82 
 
 
277 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  33.22 
 
 
289 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  27.86 
 
 
281 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0931  putative rhodanese-like sulfur transferase  27.74 
 
 
272 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186948  normal  0.41273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 
312 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  28.52 
 
 
285 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  31.71 
 
 
320 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0454  Rhodanese domain protein  30.07 
 
 
298 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.67 
 
 
285 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  31.49 
 
 
297 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  29.93 
 
 
291 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>