More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2369 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  86.12 
 
 
264 aa  357  8e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  79.81 
 
 
266 aa  322  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  79.81 
 
 
266 aa  322  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  78.37 
 
 
281 aa  321  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  79.89 
 
 
272 aa  310  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  66.81 
 
 
264 aa  294  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  65.07 
 
 
265 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  69.52 
 
 
266 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  69.05 
 
 
266 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  63.33 
 
 
266 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  69.71 
 
 
266 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  71.89 
 
 
264 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  71.89 
 
 
264 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  67.46 
 
 
264 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  71.89 
 
 
264 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  66.51 
 
 
264 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  57.78 
 
 
259 aa  265  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  62.88 
 
 
265 aa  262  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  56.89 
 
 
259 aa  261  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  69.57 
 
 
264 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  56.44 
 
 
259 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  70 
 
 
265 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  67.42 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  68.89 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  57.14 
 
 
268 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.07 
 
 
270 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  63.24 
 
 
269 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  57.41 
 
 
270 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  59.42 
 
 
529 aa  244  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  55.56 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  61.67 
 
 
258 aa  241  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  64.61 
 
 
259 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  56.28 
 
 
271 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  65.71 
 
 
266 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2556  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  66.03 
 
 
264 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0217  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  66.03 
 
 
264 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  66.67 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  53.95 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  65.71 
 
 
266 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  53.95 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  54.42 
 
 
271 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0412  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  70.27 
 
 
259 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0932  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  70.27 
 
 
259 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  57.29 
 
 
297 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  57.07 
 
 
268 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  53.95 
 
 
271 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  53.95 
 
 
271 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  53.95 
 
 
271 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  51.54 
 
 
264 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  56.59 
 
 
268 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  71.67 
 
 
266 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  60.22 
 
 
266 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  54.03 
 
 
269 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  54.03 
 
 
269 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  53.95 
 
 
271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  60.22 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  60.22 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  53.95 
 
 
271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  59.68 
 
 
268 aa  234  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  59.68 
 
 
268 aa  234  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  60.75 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  62.43 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  59.67 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  60.22 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  59.14 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  60.22 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  56.54 
 
 
281 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  56.02 
 
 
272 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  60.22 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.02 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.02 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.02 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.02 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.02 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.54 
 
 
272 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  56.25 
 
 
258 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  61.62 
 
 
286 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  60.67 
 
 
257 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  56.99 
 
 
271 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  55.19 
 
 
274 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  52.15 
 
 
270 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  59.78 
 
 
260 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  58.01 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  57.69 
 
 
260 aa  221  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  59.89 
 
 
263 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  56.91 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  57.79 
 
 
260 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  50.23 
 
 
258 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  52.76 
 
 
278 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  57.46 
 
 
263 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  52.31 
 
 
278 aa  215  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  48.68 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  53 
 
 
257 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  50.5 
 
 
258 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  52 
 
 
257 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  54.3 
 
 
279 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  53.89 
 
 
281 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  54.64 
 
 
279 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.78 
 
 
271 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>