216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5064 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  100 
 
 
323 aa  670  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  98.14 
 
 
323 aa  658  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  88.24 
 
 
323 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  86.6 
 
 
323 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  87.54 
 
 
323 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  86.92 
 
 
323 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  86.92 
 
 
323 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  86.6 
 
 
323 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  86.92 
 
 
323 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  86.92 
 
 
323 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  86.92 
 
 
323 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  86.6 
 
 
323 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  85.05 
 
 
323 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  85.36 
 
 
323 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  85.05 
 
 
323 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  84.74 
 
 
323 aa  575  1e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  84.74 
 
 
323 aa  576  1e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  85.05 
 
 
323 aa  576  1e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  84.74 
 
 
323 aa  575  1e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  84.74 
 
 
323 aa  576  1e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  83.8 
 
 
323 aa  571  1e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  72.45 
 
 
323 aa  505  1e-142  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  69.59 
 
 
325 aa  484  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  68.55 
 
 
320 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  68.12 
 
 
325 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  68.44 
 
 
325 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  68.44 
 
 
325 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  67.81 
 
 
325 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  67.81 
 
 
325 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  67.81 
 
 
325 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  67.81 
 
 
325 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  66.56 
 
 
325 aa  468  1e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  68.87 
 
 
328 aa  470  1e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  65.62 
 
 
325 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  64.69 
 
 
325 aa  458  1e-128  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  60.25 
 
 
324 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  57.63 
 
 
332 aa  405  1e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  38.39 
 
 
323 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  35.08 
 
 
332 aa  234  2e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  35.37 
 
 
328 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  34.98 
 
 
328 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  36.25 
 
 
336 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
329 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  30.91 
 
 
329 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  31.52 
 
 
329 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  31.4 
 
 
346 aa  201  1e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  31.48 
 
 
329 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  31.13 
 
 
326 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  30.72 
 
 
329 aa  193  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  30.56 
 
 
327 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  32.95 
 
 
368 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  34.14 
 
 
377 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  31.96 
 
 
323 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  34.21 
 
 
357 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  32.17 
 
 
386 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  35.29 
 
 
332 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.34 
 
 
311 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  32.3 
 
 
327 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  34.36 
 
 
332 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  30.6 
 
 
338 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.92 
 
 
402 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.96 
 
 
312 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  27.83 
 
 
328 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.44928e-05  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.75 
 
 
348 aa  139  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  28.25 
 
 
335 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  26.89 
 
 
412 aa  137  3e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.96 
 
 
311 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.5 
 
 
315 aa  136  6e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.19053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  32.1 
 
 
307 aa  135  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  29.37 
 
 
355 aa  134  2e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.17 
 
 
602 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  28.45 
 
 
396 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 
387 aa  132  7e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  27.89 
 
 
387 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  25.47 
 
 
433 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  4.16179e-06  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  27.79 
 
 
379 aa  130  4e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  28.85 
 
 
326 aa  129  5e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  29.97 
 
 
333 aa  129  1e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  26.01 
 
 
381 aa  128  2e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  27.69 
 
 
444 aa  127  2e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  25.57 
 
 
399 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  27.64 
 
 
329 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 
433 aa  125  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  28.27 
 
 
350 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  26.69 
 
 
315 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.94 
 
 
317 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  27.04 
 
 
387 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  26.33 
 
 
412 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  26.91 
 
 
388 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 
388 aa  121  1e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  26.7 
 
 
388 aa  120  2e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  26.7 
 
 
388 aa  121  2e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  26.82 
 
 
419 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  26.42 
 
 
388 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  26.5 
 
 
438 aa  120  4e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  27.01 
 
 
399 aa  120  5e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  27.99 
 
 
400 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  27.04 
 
 
388 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  25.66 
 
 
394 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  24.39 
 
 
429 aa  117  2e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>