163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3733 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  92.68 
 
 
396 aa  740    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  100 
 
 
396 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  79.85 
 
 
397 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  78.09 
 
 
396 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  76.83 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  77.33 
 
 
410 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  77.33 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  78.09 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  78.09 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  76.07 
 
 
410 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  76.07 
 
 
410 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  77.08 
 
 
397 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  76.07 
 
 
396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  76.07 
 
 
396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  75.82 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  76.07 
 
 
396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  76.07 
 
 
396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  78.09 
 
 
396 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  59.95 
 
 
397 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  62.03 
 
 
398 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  61.71 
 
 
400 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  58.23 
 
 
397 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  57.4 
 
 
397 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  52.55 
 
 
386 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  56.03 
 
 
358 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  52.36 
 
 
404 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  48.51 
 
 
424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  51.41 
 
 
384 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  52.27 
 
 
391 aa  361  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  53.19 
 
 
360 aa  342  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  50.66 
 
 
394 aa  335  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  49.11 
 
 
386 aa  335  9e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  48.19 
 
 
393 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  48.7 
 
 
375 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  53.44 
 
 
368 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  46.92 
 
 
395 aa  324  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  43.19 
 
 
393 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  52.06 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  45.55 
 
 
395 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  52.11 
 
 
337 aa  316  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  43.98 
 
 
417 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  43.72 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  43.94 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  48.97 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  49.49 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  48.68 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  44.87 
 
 
394 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  41.98 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  45.76 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  41.71 
 
 
370 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  43.54 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  41.28 
 
 
394 aa  256  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  41.13 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  41.99 
 
 
398 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  38.24 
 
 
375 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  38.24 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  40.1 
 
 
394 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  35.61 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  35.11 
 
 
398 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  31.33 
 
 
387 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  35.07 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  32.69 
 
 
385 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  29.55 
 
 
384 aa  162  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  33.06 
 
 
386 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  33.52 
 
 
377 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  33.52 
 
 
377 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  29.65 
 
 
404 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.89 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  32.33 
 
 
378 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  31.07 
 
 
386 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  34.24 
 
 
384 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  31.78 
 
 
410 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  31.79 
 
 
385 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  31.28 
 
 
385 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29.55 
 
 
397 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  30.36 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  28.53 
 
 
370 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  27.22 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  27.98 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  29.73 
 
 
386 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.38 
 
 
370 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  27.22 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  26.65 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  27.79 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  26.65 
 
 
370 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  26.65 
 
 
368 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  32.02 
 
 
358 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  26.5 
 
 
370 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  26.65 
 
 
370 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  26.36 
 
 
370 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2151  protein of unknown function DUF185  31.33 
 
 
340 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510759  normal  0.0912925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  33.06 
 
 
356 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  25.57 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  27.15 
 
 
396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  25.29 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  28.2 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  26.87 
 
 
396 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  27.49 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  29.84 
 
 
376 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  27.35 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>