More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5121 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  86.14 
 
 
433 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  75.35 
 
 
434 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  86.37 
 
 
433 aa  748    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  78.69 
 
 
453 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  86.14 
 
 
433 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  92.61 
 
 
433 aa  797    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  85.45 
 
 
433 aa  743    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  85.68 
 
 
433 aa  745    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  86.61 
 
 
433 aa  749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  77.91 
 
 
434 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  85.68 
 
 
433 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  92.15 
 
 
433 aa  795    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  77.75 
 
 
453 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  85.45 
 
 
433 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  77.91 
 
 
434 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  86.14 
 
 
433 aa  753    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  86.84 
 
 
433 aa  748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
433 aa  852    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  85.45 
 
 
433 aa  743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.69 
 
 
432 aa  625  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.6 
 
 
453 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.33 
 
 
446 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  71.03 
 
 
446 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  69 
 
 
446 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.23 
 
 
446 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.23 
 
 
449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.87 
 
 
454 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.79 
 
 
430 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  62.59 
 
 
430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.06 
 
 
430 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  62.35 
 
 
430 aa  514  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  58.35 
 
 
430 aa  500  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.2 
 
 
431 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.29 
 
 
431 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.3 
 
 
431 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.6 
 
 
431 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  58.49 
 
 
431 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.82 
 
 
431 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.6 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  56.24 
 
 
429 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  55.76 
 
 
429 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  57.88 
 
 
431 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.6 
 
 
431 aa  478  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.14 
 
 
430 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  57.65 
 
 
431 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.23 
 
 
431 aa  477  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.98 
 
 
430 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.74 
 
 
431 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  54.1 
 
 
430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.2 
 
 
431 aa  464  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.4 
 
 
429 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.86 
 
 
429 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.16 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.16 
 
 
438 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  53.63 
 
 
429 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.46 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.99 
 
 
429 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.46 
 
 
429 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.34 
 
 
446 aa  448  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.47 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  51.99 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.47 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.23 
 
 
449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.5 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.46 
 
 
429 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.46 
 
 
429 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.99 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.99 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.46 
 
 
429 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.52 
 
 
429 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.47 
 
 
449 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  54.19 
 
 
494 aa  441  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
449 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.76 
 
 
429 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.29 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  50.93 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  50.93 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.82 
 
 
433 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.82 
 
 
433 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.35 
 
 
433 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  50.24 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.93 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.24 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  50.47 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3208  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.83 
 
 
436 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238917  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  46.74 
 
 
436 aa  415  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.88 
 
 
445 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  48.83 
 
 
445 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  48.49 
 
 
445 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  48.49 
 
 
445 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.08 
 
 
460 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  48.49 
 
 
445 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  49.42 
 
 
445 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.42 
 
 
445 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  49.42 
 
 
445 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.13 
 
 
433 aa  403  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.34 
 
 
446 aa  405  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5145  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  49.42 
 
 
445 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.164927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.42 
 
 
445 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.86 
 
 
445 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>