123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4993 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 
250 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  70.64 
 
 
248 aa  342  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  67.21 
 
 
245 aa  339  3e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  67.21 
 
 
245 aa  339  3e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  66.39 
 
 
245 aa  320  1e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  66.4 
 
 
248 aa  318  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  65.57 
 
 
245 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  63.56 
 
 
254 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  63.05 
 
 
251 aa  301  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  52.49 
 
 
279 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  46.44 
 
 
256 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  45 
 
 
249 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  44.17 
 
 
250 aa  173  2e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.4 
 
 
250 aa  140  2e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.02 
 
 
247 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.22 
 
 
253 aa  129  4e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.75 
 
 
247 aa  129  5e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.5 
 
 
245 aa  127  2e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.66 
 
 
245 aa  127  2e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.8 
 
 
244 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.06 
 
 
242 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  32.8 
 
 
242 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  32.8 
 
 
242 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  34.55 
 
 
247 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.06 
 
 
242 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  33.47 
 
 
242 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  35.06 
 
 
261 aa  121  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  33.48 
 
 
234 aa  119  4e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.47 
 
 
245 aa  118  8e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  33.74 
 
 
240 aa  117  1e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  33.77 
 
 
247 aa  117  1e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  34.32 
 
 
280 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  34.32 
 
 
280 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  34.32 
 
 
280 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  34.32 
 
 
280 aa  116  4e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  34.32 
 
 
327 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  34.48 
 
 
318 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  35.89 
 
 
242 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.64 
 
 
245 aa  115  7e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  35.92 
 
 
240 aa  115  8e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  35.92 
 
 
240 aa  115  8e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.92 
 
 
240 aa  115  1e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.75 
 
 
252 aa  114  2e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.92 
 
 
240 aa  114  2e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  30 
 
 
243 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  33.05 
 
 
287 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.05 
 
 
285 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.63 
 
 
244 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.06 
 
 
278 aa  111  1e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  32.77 
 
 
263 aa  111  1e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  33.19 
 
 
263 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  34.02 
 
 
288 aa  110  2e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  33.19 
 
 
263 aa  110  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.19 
 
 
263 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  32.77 
 
 
279 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  31.93 
 
 
238 aa  109  4e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  33.19 
 
 
247 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  32.92 
 
 
243 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  32.92 
 
 
258 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  31.84 
 
 
243 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.91 
 
 
288 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  29.63 
 
 
243 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.17 
 
 
278 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  29.22 
 
 
243 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  31.84 
 
 
229 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  32.59 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  31.4 
 
 
239 aa  98.6  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  30.25 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  34.17 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.33 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  32.06 
 
 
231 aa  96.3  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.65 
 
 
247 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  30.04 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  29.71 
 
 
243 aa  85.1  1e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  30.29 
 
 
228 aa  84.3  2e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  30.67 
 
 
220 aa  83.6  3e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  30.67 
 
 
220 aa  83.6  3e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  30.67 
 
 
220 aa  83.6  3e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  31.95 
 
 
236 aa  82.4  7e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  33.97 
 
 
251 aa  80.5  3e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5914  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.55 
 
 
241 aa  79.3  6e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174556  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  34.15 
 
 
246 aa  77.8  2e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1238  putative racemase  29.86 
 
 
236 aa  76.3  5e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205483  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  32.64 
 
 
250 aa  75.5  8e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  27.98 
 
 
219 aa  75.1  9e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  29.33 
 
 
216 aa  75.1  1e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5283  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.62 
 
 
241 aa  73.9  2e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  32.04 
 
 
205 aa  73.2  3e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  26.12 
 
 
241 aa  72  8e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3252  hypothetical protein  30.46 
 
 
276 aa  70.5  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5137  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.82 
 
 
239 aa  70.5  3e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  32.35 
 
 
267 aa  69.7  5e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5144  Asp/Glu racemase  29.76 
 
 
223 aa  68.6  9e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2468  Asp/Glu racemase  31.75 
 
 
250 aa  68.6  9e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  29.27 
 
 
252 aa  67.8  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  30.57 
 
 
252 aa  66.6  4e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  29.13 
 
 
238 aa  66.2  4e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.16 
 
 
226 aa  65.9  6e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.48 
 
 
247 aa  63.2  4e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 
627 aa  63.2  4e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>