More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1176 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  100 
 
 		 234 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  55.71 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  54.09 
 
 		 227 aa  241  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  54.29 
 
 		 239 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  53.81 
 
 		 239 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  54.29 
 
 		 239 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  53.81 
 
 		 239 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  55.56 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  53.81 
 
 		 242 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  52.48 
 
 		 246 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  52.48 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  53.4 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  51.46 
 
 		 243 aa  222  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  48.67 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  53.4 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  46.6 
 
 		 218 aa  208  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  48.04 
 
 		 211 aa  205  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  53.2 
 
 		 220 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  45.28 
 
 		 217 aa  204  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  48.53 
 
 		 211 aa  204  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  51.49 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  50.25 
 
 		 234 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  51.49 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  51.49 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  51.49 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  51.49 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  51.49 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  51.49 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  50.99 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  48.29 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  48.33 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  49.75 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  47.85 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  48.48 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  50.5 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  50.5 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  47.22 
 
 		 258 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  50.5 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  51.49 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  47.6 
 
 		 225 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  50 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  48.48 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  49.75 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  52.22 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  49.51 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  50.53 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  49.75 
 
 		 219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  49.76 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  49.02 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  49.02 
 
 		 219 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  49.26 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  49.26 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  49.26 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  49.26 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  48.31 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  49.01 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  49.01 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  46.86 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  41.58 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  44.56 
 
 		 278 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  44.56 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  44.56 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  40.89 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  42.86 
 
 		 272 aa  174  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  49.47 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  39 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  38.03 
 
 		 356 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  43.52 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  46.59 
 
 		 182 aa  158  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  38.97 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  40 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  38.92 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  36.54 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  34.63 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3517  carbonic anhydrase  40.51 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2962  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 201 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0504  Carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  35.24 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  38.46 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  35.32 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0067  carbonic anhydrase  38.12 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  34.31 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  40.93 
 
 		 220 aa  135  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2001  carbonate dehydratase  36.63 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  39.69 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2841  carbonate dehydratase  40 
 
 		 196 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  34.62 
 
 		 216 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  33.49 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  37.67 
 
 		 877 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  38.35 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>