135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2209 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 444 aa  871    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  65.81 
 
 		 447 aa  502  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  62.23 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  62.47 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  61.96 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  58.16 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  58.33 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  56.61 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  58.06 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  56.64 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  57.66 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  59.33 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  58.81 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  55 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  58.69 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  55.76 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  55.79 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  61.39 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  54.39 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  52.97 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  55.22 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  55 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  55 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  56.19 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  52.73 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  53.44 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  54.76 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  54.76 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  58.96 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  54.52 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  54.76 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  61.72 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  56.53 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  53.96 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  56.77 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  52.03 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  53.37 
 
 		 418 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  55.71 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  56.5 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  56.53 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  53.1 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  56.32 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  57.42 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  52.98 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  56.83 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  57.28 
 
 		 421 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  56.87 
 
 		 413 aa  363  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  53.08 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  57.93 
 
 		 421 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  51.88 
 
 		 432 aa  355  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  62.23 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  52.37 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  51.53 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  51.98 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  53 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  49.02 
 
 		 404 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  48.5 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  46.56 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  50.24 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  49.88 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  48.17 
 
 		 432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  46.9 
 
 		 450 aa  306  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  50.58 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  52.21 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  49.75 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  49.47 
 
 		 374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  51.86 
 
 		 423 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  46.06 
 
 		 447 aa  285  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  43.12 
 
 		 424 aa  280  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  42.86 
 
 		 409 aa  279  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  47.61 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  44.24 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  44.47 
 
 		 437 aa  273  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  42.66 
 
 		 422 aa  272  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  42.05 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  44.01 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  46.78 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  45.09 
 
 		 426 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  42.64 
 
 		 443 aa  259  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  40.13 
 
 		 459 aa  259  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  46.27 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  44.47 
 
 		 439 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  34.29 
 
 		 412 aa  252  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  41.42 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  43.06 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  34.31 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  40.15 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  45.52 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  39.07 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  39.07 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  42.22 
 
 		 496 aa  246  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  45.45 
 
 		 426 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0771  hydroxypyruvate reductase  70.56 
 
 		 235 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  43.26 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  44.44 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  43.67 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  44.59 
 
 		 317 aa  240  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  44.14 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  45.98 
 
 		 453 aa  232  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  43.11 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>