More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0469 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  46.24 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  45.49 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  45.49 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  47.5 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  40.61 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  39.69 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  41.86 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  36.94 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  58.59 
 
 		 656 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2101  Ankyrin  43.15 
 
 		 153 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1423  ankyrin  40.41 
 
 		 152 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1462  ankyrin repeat-containing protein  39.26 
 
 		 196 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  40.82 
 
 		 112 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  40.24 
 
 		 110 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  41.24 
 
 		 110 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  36.04 
 
 		 109 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  40.82 
 
 		 109 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  36.63 
 
 		 107 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  40.21 
 
 		 110 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  39.8 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  39.8 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  37.76 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  37 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  37 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  37 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  39.39 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 102 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  33 
 
 		 101 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  36.89 
 
 		 103 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 102 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 102 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  39.09 
 
 		 110 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 101 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 101 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  36.63 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  43.37 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7751  ankyrin  32.94 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 106 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3944  ankyrin  39.5 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0207728 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  40 
 
 		 107 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  36 
 
 		 106 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  34.82 
 
 		 110 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  35.71 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  30.39 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  31.82 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  31 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 129 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  32.06 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  35.77 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  31.37 
 
 		 106 aa  72  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  32.29 
 
 		 108 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2348  ankyrin  37.68 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.614743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  31.19 
 
 		 107 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  31.31 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  31.31 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  31.31 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  31.31 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  31.31 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  31.31 
 
 		 108 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  32.32 
 
 		 108 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30.56 
 
 		 127 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  31.31 
 
 		 108 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  31.31 
 
 		 108 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.31 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  32.63 
 
 		 479 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 476 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 1198 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  34.02 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  39.05 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  34.02 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  32.32 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  29.7 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  39.22 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  29.29 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>