75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15510 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  487  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  41.63 
 
 
383 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  42.61 
 
 
388 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  41.06 
 
 
270 aa  139  4e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  41.06 
 
 
270 aa  139  4e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  41.06 
 
 
270 aa  139  4e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  39.81 
 
 
309 aa  134  1e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  39.74 
 
 
292 aa  132  4e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  34.84 
 
 
273 aa  128  8e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  40.85 
 
 
254 aa  127  2e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  34.5 
 
 
436 aa  127  2e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  36.44 
 
 
271 aa  126  4e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  43.01 
 
 
333 aa  126  4e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  40.93 
 
 
254 aa  126  4e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  38.35 
 
 
255 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  39.22 
 
 
246 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  41.9 
 
 
258 aa  121  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  36.36 
 
 
283 aa  114  1e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  36.07 
 
 
305 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  36.87 
 
 
309 aa  112  4e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  35.57 
 
 
571 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  40.32 
 
 
248 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  35.78 
 
 
296 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  32.29 
 
 
230 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  32.37 
 
 
245 aa  84  2e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  29.33 
 
 
234 aa  82.8  5e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  29.02 
 
 
234 aa  82  8e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  28.27 
 
 
235 aa  81.6  9e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.89323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  33.7 
 
 
234 aa  78.6  1e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  30.11 
 
 
235 aa  77.8  2e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  32.93 
 
 
233 aa  76.6  3e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  27.83 
 
 
247 aa  73.6  3e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  26.25 
 
 
245 aa  70.5  2e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  28.3 
 
 
234 aa  67.4  2e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  25.22 
 
 
233 aa  67  3e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  26.51 
 
 
242 aa  64.7  1e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  23.64 
 
 
243 aa  64.3  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  26.64 
 
 
240 aa  64.7  2e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  26.34 
 
 
243 aa  62.8  5e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  26.81 
 
 
239 aa  62.8  6e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  27.89 
 
 
234 aa  62.4  6e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  26.54 
 
 
253 aa  61.6  1e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  22.97 
 
 
243 aa  60.8  2e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  21.46 
 
 
238 aa  59.3  5e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  27.18 
 
 
244 aa  58.9  7e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  29.3 
 
 
238 aa  58.9  7e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  21.03 
 
 
238 aa  58.5  1e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  32.79 
 
 
215 aa  57  3e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  27.94 
 
 
273 aa  56.2  5e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  33.16 
 
 
315 aa  55.8  7e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  39.39 
 
 
301 aa  53.9  2e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  35.14 
 
 
286 aa  53.9  2e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  27.09 
 
 
272 aa  52.4  7e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  28.34 
 
 
286 aa  52  8e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  22.51 
 
 
236 aa  51.2  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  23.32 
 
 
243 aa  50.8  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  35.29 
 
 
306 aa  50.1  4e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  23.47 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  28.28 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  27.37 
 
 
230 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  31.37 
 
 
306 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  36 
 
 
273 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  35.51 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  26.04 
 
 
278 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  26.04 
 
 
278 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  26.04 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  22.39 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  28.44 
 
 
331 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  33.07 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  32.74 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  28.03 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  30.63 
 
 
307 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  28.12 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  34.17 
 
 
299 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>