89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4014 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  100 
 
 
299 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  40.15 
 
 
292 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  35.51 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  40.7 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  34.11 
 
 
297 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  33.57 
 
 
304 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  33.57 
 
 
304 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  33.57 
 
 
304 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  35.68 
 
 
273 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  42.07 
 
 
307 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  32.63 
 
 
286 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  34.98 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  35.62 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  30.59 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  32.26 
 
 
290 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  32.44 
 
 
242 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  31.28 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  29.82 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  39.57 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  38.84 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  31.44 
 
 
315 aa  86.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  30.36 
 
 
249 aa  85.5  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  34.44 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  33.01 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  27.42 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  31.58 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  33.95 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  29.82 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  28.14 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  31.54 
 
 
243 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  30.14 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  30.14 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  31.96 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  30.14 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  24.47 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  28 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  26.84 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  28.04 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  25.33 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  27.46 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  26.81 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  28.63 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  29.55 
 
 
215 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  49.41 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  28.22 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  27.57 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  26.85 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  31.47 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  43.48 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  27.46 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  26.26 
 
 
272 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  27.37 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  28.72 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  28.1 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  28.99 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  28.09 
 
 
252 aa  59.3  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  33.33 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  29.37 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  29.13 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  38.14 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  34.62 
 
 
243 aa  57  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1895  protein of unknown function DUF881  37.07 
 
 
238 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  26.72 
 
 
240 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  28.77 
 
 
249 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  27.84 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  23.16 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  29.81 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  31.33 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  28.21 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  24.04 
 
 
235 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  26.55 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1025  protein of unknown function DUF881  26.09 
 
 
239 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540335  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  25.71 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  27.12 
 
 
230 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  31.91 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  32.39 
 
 
436 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  22.17 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  29.22 
 
 
243 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  21.97 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  29.94 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  25.99 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  29.35 
 
 
246 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  24.59 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  31.68 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  34.94 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  32.38 
 
 
245 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  21.88 
 
 
280 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  26.7 
 
 
273 aa  42.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>