More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12550 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 949 aa  698    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 925 aa  704    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 		 951 aa  1070    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  61.35 
 
 		 968 aa  1177    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 969 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 984 aa  1167    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 944 aa  692    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 857 aa  759    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  54.85 
 
 		 994 aa  1078    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 952 aa  1069    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 950 aa  1086    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 936 aa  800    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 985 aa  2006    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 		 954 aa  1160    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 982 aa  1178    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 954 aa  696    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 		 990 aa  1181    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 936 aa  699    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 1064 aa  1004    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 952 aa  1144    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 		 978 aa  1124    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 		 949 aa  1102    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 949 aa  1055    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 922 aa  690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 1016 aa  1003    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 971 aa  1080    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  56.38 
 
 		 934 aa  1053    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 971 aa  1082    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 921 aa  716    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 958 aa  1093    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  46.71 
 
 		 879 aa  652    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 906 aa  658    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 963 aa  1104    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 		 969 aa  1016    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 984 aa  1138    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 978 aa  1194    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 971 aa  1080    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 968 aa  1065    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 987 aa  1093    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 923 aa  706    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 802 aa  623  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 833 aa  619  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 833 aa  620  1e-176  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 838 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 805 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 802 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 805 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 802 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 802 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 802 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 802 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 854 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 802 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 804 aa  597  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 829 aa  593  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 858 aa  591  1e-167  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 835 aa  591  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 806 aa  582  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 808 aa  582  1e-164  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 840 aa  574  1.0000000000000001e-162  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 804 aa  565  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 805 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 805 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 806 aa  555  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 807 aa  552  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 805 aa  547  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 829 aa  549  1e-154  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 805 aa  545  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 805 aa  544  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 816 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 806 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 858 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 819 aa  521  1e-146  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 843 aa  522  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1984  leucyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 841 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000675596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 801 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 		 868 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 857 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 868 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 906 aa  516  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2429  leucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 820 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 868 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1884  leucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 848 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.439942  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  40.97 
 
 		 899 aa  506  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1446  leucyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 894 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 824 aa  501  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 882 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 800 aa  500  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 856 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 830 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 856 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 854 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 830 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7138  leucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 828 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 810 aa  493  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 878 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>