27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00560 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00560  sugar phosphate isomerase/epimerase  100 
 
 		 309 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00706398  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28710  sugar phosphate isomerase/epimerase  71.66 
 
 		 307 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0885144  normal  0.0589318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1920  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.06 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3101  xylose isomerase domain-containing protein  48.01 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4227  xylose isomerase domain-containing protein  46.15 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.220336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0883  xylose isomerase domain-containing protein  45.18 
 
 		 334 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0182  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  45.28 
 
 		 321 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000874694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  44.81 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  0.2091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0622  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0499  xylose isomerase domain-containing protein  24.88 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.21 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207332  normal  0.133468 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0146  hexulose-6-phosphate isomerase  19.86 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  25.3 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0126  hexulose-6-phosphate isomerase  19.51 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1536  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.4 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3314  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.49 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0346457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  25.71 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1537  xylose isomerase domain-containing protein  24.69 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0649  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  20.31 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2296  xylose isomerase domain-containing protein  24.07 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  0.299582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3527  xylose isomerase domain-containing protein  27.5 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3088  hydroxypyruvate isomerase  25.69 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  27.33 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1811  putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase  19.25 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00140377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2516  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.73 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.610941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.27 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1458  xylose isomerase-like TIM barrel  23.21 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.314242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>