190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3024 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  100 
 
 
248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  93.55 
 
 
248 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  93.55 
 
 
248 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  93.55 
 
 
248 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  93.55 
 
 
248 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  93.55 
 
 
248 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  93.55 
 
 
248 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  93.55 
 
 
248 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  93.55 
 
 
248 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  93.15 
 
 
248 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  90.73 
 
 
248 aa  470  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  57.89 
 
 
263 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  55.06 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  32.4 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  28.51 
 
 
253 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  28.33 
 
 
244 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  27.69 
 
 
261 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  28.69 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.41 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 
273 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  26.91 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  25.78 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  29.13 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 
253 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 
254 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  27.6 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 
257 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  26.86 
 
 
251 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  26.42 
 
 
259 aa  105  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  30.09 
 
 
283 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  31.55 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 
246 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  32.35 
 
 
217 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  28.28 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  29.05 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  27.35 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  25.56 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  24.58 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  25.93 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 
256 aa  89  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  25.23 
 
 
253 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  26.29 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.23 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  26.75 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22.92 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  26.51 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  27.74 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  25.93 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  29.24 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  25.7 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  27.02 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  27.02 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  21.49 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  26.9 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  26.94 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  26.86 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  27.12 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  27.05 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  22.04 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  26.91 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  24 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  23.01 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  28.65 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  22.94 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  27.32 
 
 
255 aa  72  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  26.61 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  26.9 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  28.95 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  29.14 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  25 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  28.57 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  21.94 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  28.21 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  28.21 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  27.22 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  28.16 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  25.31 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  25.15 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  24 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  28.89 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  25.15 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  27.17 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  25.15 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  28.9 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  26.18 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  28.74 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  26.11 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  26.11 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  25.73 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  27.75 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  22.44 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>