56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2112 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  97.54 
 
 
488 aa  894  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  97.95 
 
 
488 aa  873  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  97.54 
 
 
488 aa  894  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  74.9 
 
 
488 aa  697  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  85.92 
 
 
484 aa  785  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  85.71 
 
 
484 aa  784  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  87.06 
 
 
488 aa  806  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  85.71 
 
 
484 aa  784  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  85.92 
 
 
484 aa  785  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
498 aa  983  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  86.04 
 
 
488 aa  794  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  85.92 
 
 
484 aa  785  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  92.81 
 
 
488 aa  830  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  97.54 
 
 
488 aa  893  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  86.04 
 
 
488 aa  794  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  75 
 
 
488 aa  717  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  97.54 
 
 
488 aa  870  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  71.14 
 
 
492 aa  655  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  56.35 
 
 
486 aa  494  1e-138  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  35.02 
 
 
488 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  33.05 
 
 
478 aa  240  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  35.22 
 
 
499 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  35.22 
 
 
499 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  29.98 
 
 
473 aa  185  1e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 
422 aa  132  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 
429 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
509 aa  130  4e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  29.38 
 
 
424 aa  124  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 
419 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
468 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 
504 aa  84.7  4e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
499 aa  73.2  1e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  20.85 
 
 
504 aa  68.6  3e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  24.58 
 
 
506 aa  61.6  3e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
497 aa  60.1  1e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
533 aa  58.9  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  32.69 
 
 
507 aa  58.2  3e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
519 aa  57.4  6e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
446 aa  54.7  4e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
504 aa  53.1  1e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  20.64 
 
 
494 aa  52.4  2e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.46 
 
 
504 aa  52  3e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.51 
 
 
484 aa  50.4  7e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 
507 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 
427 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 
484 aa  47  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
522 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  21.07 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  19.94 
 
 
501 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
483 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  5.72815e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.12 
 
 
486 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 
427 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>