40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2050 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  100 
 
 
142 aa  276  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  82.39 
 
 
142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  81.69 
 
 
142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  64.93 
 
 
142 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  64.93 
 
 
142 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  61.97 
 
 
142 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  64.18 
 
 
142 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  64.18 
 
 
142 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  64.18 
 
 
142 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  64.18 
 
 
142 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  53.44 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  46.67 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  40.44 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  34.93 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  38.84 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  38.46 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  29.75 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  44.9 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  36.19 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  32.91 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  46 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  46 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  27.93 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  26.72 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  31.3 
 
 
137 aa  43.9  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  32.31 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  32.31 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  32.31 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  32.31 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  32.31 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  27.61 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  32.31 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  32 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  42.55 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  38 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  35.48 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  38.18 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0801  TadE family protein  48.08 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  38.3 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>