234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4935 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  100 
 
 
143 aa  297  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  60.9 
 
 
152 aa  177  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  51.91 
 
 
147 aa  150  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  56.06 
 
 
148 aa  150  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  49.22 
 
 
153 aa  136  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  54.96 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4918  cytidyltransferase-related  41.13 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.3 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  38.69 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  38.52 
 
 
386 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.82 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.07 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  32.35 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  31.11 
 
 
512 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.31 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  38.95 
 
 
495 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  38.46 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  31.25 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.59 
 
 
437 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  31.25 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.71 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.71 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  30.3 
 
 
488 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  36.46 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.23 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  37.23 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  33.04 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  36.46 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  30.47 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  30.77 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  32.06 
 
 
464 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.89 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.47 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0354  rfaE bifunctional protein  35.79 
 
 
486 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  29.71 
 
 
151 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  32.43 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  29.01 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  37.23 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.71 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  30.93 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  30.63 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.88 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  30.63 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  32.37 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0662  rfaE bifunctional protein  35.42 
 
 
485 aa  57.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.23 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  35.42 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  32.29 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  31.78 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  35.42 
 
 
490 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.69 
 
 
187 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0401  rfaE bifunctional protein  32.63 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53449  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33520  predicted protein  36.73 
 
 
337 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0371958  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  31 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  31.96 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1846  rfaE bifunctional protein  36.46 
 
 
484 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  27.05 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.92 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2823  rfaE bifunctional protein  36.08 
 
 
200 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2277  rfaE bifunctional protein  34.38 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2261  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31.96 
 
 
477 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1813  rfaE bifunctional protein  32 
 
 
472 aa  54.7  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04100  choline-phosphate cytidylyltransferase, putative  46.38 
 
 
453 aa  54.3  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00623495  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0123  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  35.79 
 
 
496 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4946  rfaE bifunctional protein  34.02 
 
 
488 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.169495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0580  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  31.63 
 
 
477 aa  53.9  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000433477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  34.83 
 
 
170 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  34.38 
 
 
490 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  29.03 
 
 
451 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  40.3 
 
 
371 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0505  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31 
 
 
480 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  29.6 
 
 
455 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  30 
 
 
458 aa  52  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
488 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  26.06 
 
 
468 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  34.07 
 
 
461 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0477  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  32 
 
 
457 aa  51.6  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  31.25 
 
 
490 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1031  rfaE bifunctional protein  32.65 
 
 
501 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  32.29 
 
 
490 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1591  cytidyltransferase-related domain protein  33.8 
 
 
363 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2810  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  32.99 
 
 
477 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1065  rfaE bifunctional protein  28.68 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0834  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  28.15 
 
 
475 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1895  rfaE bifunctional protein  30.85 
 
 
488 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.200594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2613  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  27.91 
 
 
502 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0100846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0461  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
464 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.640202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1766  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.06 
 
 
165 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66348  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1299  bifunctional ADP-heptose synthase  30.21 
 
 
489 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  32.63 
 
 
223 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3200  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.92 
 
 
476 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.923411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  29.17 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3404  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.13 
 
 
478 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3563  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  28.35 
 
 
478 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  29.79 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  32.26 
 
 
484 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  26.92 
 
 
487 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>