37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04100 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA04100  choline-phosphate cytidylyltransferase, putative  100 
 
 
453 aa  936    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00623495  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01357  cholinephosphate cytidylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G09290)  45.25 
 
 
451 aa  179  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.48081  normal  0.256362 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31198  phosphorylcholine transferase  50.68 
 
 
475 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.862936 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33520  predicted protein  39.55 
 
 
337 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0371958  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04303  phosphoethanolamine (AFU_orthologue; AFUA_4G05940)  36.42 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0916594  normal  0.13983 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44584  predicted protein  41.38 
 
 
533 aa  96.3  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  35.82 
 
 
371 aa  89.7  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76493  choline phosphate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.562942  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
185 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  45.95 
 
 
152 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.89 
 
 
131 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  46.38 
 
 
143 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.23 
 
 
142 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  28.78 
 
 
130 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  27.61 
 
 
131 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  30.37 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  25 
 
 
143 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.46 
 
 
133 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
152 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  26.02 
 
 
133 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  27.34 
 
 
132 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  43.28 
 
 
146 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.01 
 
 
139 aa  47.4  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.88 
 
 
151 aa  47.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  40 
 
 
147 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  25 
 
 
132 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  25 
 
 
132 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  30.08 
 
 
130 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.72 
 
 
187 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.22 
 
 
158 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  25 
 
 
132 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.79 
 
 
132 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  43.28 
 
 
148 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  28.15 
 
 
129 aa  43.9  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.88 
 
 
127 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  26.83 
 
 
167 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4960  cytidyltransferase-related domain protein  36 
 
 
163 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.586788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>