93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_76493 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_76493  choline phosphate cytidylyltransferase  100 
 
 
354 aa  733    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.562942  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04303  phosphoethanolamine (AFU_orthologue; AFUA_4G05940)  45.98 
 
 
442 aa  318  7.999999999999999e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0916594  normal  0.13983 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  33.52 
 
 
371 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33520  predicted protein  33.71 
 
 
337 aa  157  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0371958  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04100  choline-phosphate cytidylyltransferase, putative  33.33 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00623495  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01357  cholinephosphate cytidylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G09290)  36.44 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.48081  normal  0.256362 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31198  phosphorylcholine transferase  34.75 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.862936 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44584  predicted protein  35.96 
 
 
533 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1391  rfaE bifunctional protein  30.19 
 
 
488 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.114301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1792  bifunctional ADP-heptose synthase  40.62 
 
 
491 aa  53.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1065  rfaE bifunctional protein  30.21 
 
 
164 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  34.57 
 
 
491 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  33.77 
 
 
490 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1616  bifunctional ADP-heptose synthase  26.04 
 
 
163 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2543  rfaE bifunctional protein  35.62 
 
 
152 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3773  rfaE bifunctional protein  27.63 
 
 
482 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889229  normal  0.588929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  32.69 
 
 
490 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4553  rfaE bifunctional protein  27.78 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3475  rfaE bifunctional protein  26.17 
 
 
475 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  34.29 
 
 
161 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  31.87 
 
 
488 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66060  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.38 
 
 
474 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  37.68 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0123  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  23.33 
 
 
496 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0576  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  25.96 
 
 
475 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1184  rfaE bifunctional protein  32.88 
 
 
154 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  32.18 
 
 
169 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  22.34 
 
 
162 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0578  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  31.58 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5731  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.38 
 
 
474 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2277  rfaE bifunctional protein  28.21 
 
 
163 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2261  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  25.51 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  33.73 
 
 
175 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1071  cytidyltransferase-related, RfaE bifunctional protein  32.14 
 
 
488 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136639  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1813  rfaE bifunctional protein  29.59 
 
 
472 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1615  bifunctional ADP-heptose synthase  28.57 
 
 
490 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4946  rfaE bifunctional protein  26.67 
 
 
488 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.169495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  34.62 
 
 
487 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1603  bifunctional D-beta-D-heptose 7-phosphate kinase/D-beta-D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase  28.57 
 
 
490 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0769  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  27.37 
 
 
488 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0662  rfaE bifunctional protein  27.5 
 
 
485 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1432  bifunctional ADP-heptose synthase  23.33 
 
 
490 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  29.67 
 
 
490 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2613  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.27 
 
 
502 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0100846  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1286  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  31.88 
 
 
461 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2602  rfaE bifunctional protein  34.43 
 
 
170 aa  46.6  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  34.62 
 
 
487 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1299  bifunctional ADP-heptose synthase  26.67 
 
 
489 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3605  bifunctional ADP-heptose synthase  22.22 
 
 
168 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0597  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.38 
 
 
473 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5668  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  28.57 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0354  rfaE bifunctional protein  23.33 
 
 
486 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  26.51 
 
 
153 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44680  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  32.1 
 
 
474 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0537  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.85 
 
 
474 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.673885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4983  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfaE  33.85 
 
 
474 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0017  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.82 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4507  rfaE bifunctional protein  27.78 
 
 
490 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0477  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  34.78 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4934  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.85 
 
 
473 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4983  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.85 
 
 
473 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0532  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.85 
 
 
473 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0351851 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  26.97 
 
 
458 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  26.26 
 
 
472 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  25.22 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0484  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.38 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4806  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.85 
 
 
473 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  25.56 
 
 
159 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3404  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  26.17 
 
 
478 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1167  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  33.85 
 
 
461 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  22.22 
 
 
484 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0401  rfaE bifunctional protein  32.53 
 
 
158 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53449  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  26.67 
 
 
158 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  31.58 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  22.82 
 
 
172 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  28 
 
 
488 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1750  cytidyltransferase-like protein  28.89 
 
 
502 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3563  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.91 
 
 
478 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4289  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  25.97 
 
 
476 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0580  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  28.87 
 
 
477 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000433477  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  28.85 
 
 
495 aa  43.5  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1895  rfaE bifunctional protein  24.32 
 
 
488 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.200594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1764  cytidyltransferase-like protein  33.33 
 
 
501 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  29.17 
 
 
143 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1554  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  33.93 
 
 
494 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.431302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1846  rfaE bifunctional protein  22.97 
 
 
484 aa  43.1  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2810  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  24.73 
 
 
477 aa  43.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  28.89 
 
 
170 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.14 
 
 
132 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  26.04 
 
 
163 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1704  rfaE bifunctional protein  23.85 
 
 
479 aa  42.7  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  25.53 
 
 
151 aa  42.7  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30.59 
 
 
481 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>