48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44584 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44584  predicted protein  100 
 
 
533 aa  1104    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04100  choline-phosphate cytidylyltransferase, putative  41.38 
 
 
453 aa  97.4  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00623495  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33520  predicted protein  38.81 
 
 
337 aa  87.8  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0371958  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  37.23 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01357  cholinephosphate cytidylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G09290)  34.46 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.48081  normal  0.256362 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04303  phosphoethanolamine (AFU_orthologue; AFUA_4G05940)  38.06 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0916594  normal  0.13983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  35 
 
 
132 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31198  phosphorylcholine transferase  30.38 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.862936 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76493  choline phosphate cytidylyltransferase  35.96 
 
 
354 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.562942  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.07 
 
 
152 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  28.03 
 
 
130 aa  55.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  31.2 
 
 
143 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  30.77 
 
 
129 aa  54.3  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  41.43 
 
 
169 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  27.74 
 
 
131 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  27.74 
 
 
131 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  38.24 
 
 
172 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.4 
 
 
131 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  26.21 
 
 
139 aa  50.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  30.22 
 
 
130 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  30 
 
 
488 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  24.44 
 
 
131 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  34.29 
 
 
162 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40.32 
 
 
142 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  35.82 
 
 
170 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  27.07 
 
 
167 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  39.39 
 
 
147 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04740  diacylglycerol cholinephosphotransferase, putative  26.67 
 
 
430 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.286986  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04778  aminoalcoholphosphotransferase (AFU_orthologue; AFUA_3G06650)  23.65 
 
 
412 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547098  normal  0.367098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  25.36 
 
 
185 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.1 
 
 
151 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  28.06 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1591  cytidyltransferase-related domain protein  27.1 
 
 
363 aa  45.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  25.37 
 
 
132 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4960  cytidyltransferase-related domain protein  35.62 
 
 
163 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.586788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0484  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.08 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198605  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  25.55 
 
 
133 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.05 
 
 
144 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1909  cytidyltransferase-related domain protein  37.5 
 
 
143 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0344857  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0537  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30 
 
 
474 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.673885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  39.39 
 
 
152 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  38.03 
 
 
156 aa  44.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0209  cytidyltransferase-like protein  35.71 
 
 
148 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0201  rfaE bifunctional protein  27.14 
 
 
160 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  27.14 
 
 
490 aa  44.3  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.13 
 
 
187 aa  44.3  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  34.78 
 
 
179 aa  43.9  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  35.29 
 
 
153 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>