72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1173 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  60.44 
 
 
266 aa  265  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  59.03 
 
 
241 aa  260  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  55.31 
 
 
247 aa  251  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  55.9 
 
 
230 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  45.89 
 
 
225 aa  181  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  46.43 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  43.29 
 
 
224 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.39 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  28.29 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  31.38 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  31.58 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  28.27 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  30.72 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  30.54 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  29.51 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  26.29 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.57 
 
 
244 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  27.86 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  27.86 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  30.04 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0611  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.34 
 
 
449 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.255649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  27.5 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  28.75 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  27.78 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.59 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  29.25 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  29.25 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  29.25 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  29.25 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  29.25 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  29.25 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  29.25 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  31.71 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06671  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.88 
 
 
449 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.432114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  26.14 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  27.1 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06371  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.85 
 
 
449 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  27.94 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  26.16 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  26.03 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  25.93 
 
 
263 aa  46.6  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  29.09 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1696  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  34.23 
 
 
451 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.157668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2448  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.45 
 
 
453 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420996  hitchhiker  0.000000146766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2348  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.43 
 
 
451 aa  45.1  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.05 
 
 
255 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4421  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.05 
 
 
453 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0508871  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
411 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1776  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.11 
 
 
451 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0205  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.29 
 
 
458 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0985366  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  32.17 
 
 
411 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4359  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.05 
 
 
453 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3072  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.06 
 
 
453 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  31.67 
 
 
414 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10391  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.87 
 
 
453 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
411 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  32.39 
 
 
391 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1051  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  36.67 
 
 
491 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  26.64 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2742  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  31.73 
 
 
476 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.19388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  28.57 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  26.64 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06761  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.03 
 
 
447 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  28.78 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  26.59 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.94 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  26.45 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.61 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.45 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  31.09 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  26.36 
 
 
254 aa  42  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>