96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0740 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  656  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  36.66 
 
 
321 aa  147  2e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  36.9 
 
 
299 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  34.69 
 
 
262 aa  114  2e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  38.15 
 
 
317 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  31.1 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  6.67209e-05 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  40.29 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  36.02 
 
 
374 aa  83.6  4e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  31.65 
 
 
335 aa  83.2  6e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  29.84 
 
 
320 aa  82.4  9e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  40.83 
 
 
310 aa  81.6  2e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  34.08 
 
 
310 aa  80.1  5e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  38.89 
 
 
309 aa  79  1e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  41.73 
 
 
295 aa  79  1e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6926e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  37.35 
 
 
301 aa  75.5  1e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  31.32 
 
 
347 aa  73.6  4e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  35.56 
 
 
284 aa  72.8  8e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  35.56 
 
 
284 aa  72.4  9e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  35.56 
 
 
284 aa  72.4  9e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  39.2 
 
 
306 aa  71.6  2e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  32.76 
 
 
293 aa  70.9  3e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  32.97 
 
 
307 aa  69.3  8e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  35.02 
 
 
307 aa  67.8  2e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  37.64 
 
 
295 aa  68.6  2e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  34.09 
 
 
294 aa  67.8  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  33.17 
 
 
289 aa  66.2  8e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  28.16 
 
 
329 aa  66.2  8e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  31.22 
 
 
296 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  34.6 
 
 
325 aa  65.5  1e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  35.36 
 
 
284 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  35.36 
 
 
284 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  40 
 
 
281 aa  64.7  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  35.36 
 
 
284 aa  64.3  3e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  36.14 
 
 
307 aa  63.5  4e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  36.43 
 
 
289 aa  63.5  5e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  35.46 
 
 
290 aa  63.2  7e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  35.46 
 
 
290 aa  63.2  7e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  35.46 
 
 
290 aa  63.2  7e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  37.61 
 
 
320 aa  62.8  9e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  37.61 
 
 
320 aa  62.8  9e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  37.61 
 
 
320 aa  62.8  9e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  35.62 
 
 
303 aa  62  1e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  33.62 
 
 
305 aa  62.4  1e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  38.33 
 
 
281 aa  62.4  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  38.33 
 
 
281 aa  62.4  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  35.48 
 
 
289 aa  61.2  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  37.78 
 
 
327 aa  61.2  2e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  36.22 
 
 
320 aa  61.6  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  35.48 
 
 
289 aa  61.2  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  36.22 
 
 
320 aa  61.6  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  38.98 
 
 
294 aa  60.8  3e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  33.9 
 
 
318 aa  61.2  3e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  38.79 
 
 
320 aa  60.5  4e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  38.14 
 
 
298 aa  58.9  1e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  34.45 
 
 
279 aa  58.9  1e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  3.00083e-06 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  34.25 
 
 
280 aa  58.2  2e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  33.51 
 
 
339 aa  58.2  2e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  35.54 
 
 
288 aa  57  5e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  36.44 
 
 
277 aa  56.6  6e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  36.44 
 
 
277 aa  56.6  6e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  34.09 
 
 
303 aa  55.5  1e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  33.71 
 
 
267 aa  55.8  1e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  36.72 
 
 
259 aa  55.1  2e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  35.2 
 
 
286 aa  54.7  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  31.17 
 
 
331 aa  54.7  2e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  37.21 
 
 
352 aa  54.7  2e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  35.2 
 
 
286 aa  54.7  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  36.36 
 
 
278 aa  54.3  3e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  36.52 
 
 
289 aa  53.9  4e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  36.08 
 
 
289 aa  53.9  4e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  35.34 
 
 
300 aa  53.5  5e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  35.34 
 
 
300 aa  53.5  5e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  35.34 
 
 
300 aa  53.1  6e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  31.37 
 
 
291 aa  53.1  7e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  33.65 
 
 
278 aa  53.1  7e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  31.69 
 
 
289 aa  52.8  9e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  34.75 
 
 
277 aa  52.8  9e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  35.25 
 
 
275 aa  52.4  1e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  36.07 
 
 
294 aa  51.6  2e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  29.48 
 
 
313 aa  50.8  3e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0539  hypothetical protein  38.38 
 
 
303 aa  50.8  4e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  34 
 
 
306 aa  50.4  5e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  33.9 
 
 
291 aa  50.1  5e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  32.5 
 
 
283 aa  50.1  5e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  33.9 
 
 
291 aa  50.1  5e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  29.32 
 
 
302 aa  49.7  7e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.6316e-11 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  30.12 
 
 
304 aa  49.7  8e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  34.45 
 
 
289 aa  49.3  8e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  40.34 
 
 
261 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  33.09 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  28.96 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  32.12 
 
 
351 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  34.35 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  31.49 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0968  hypothetical protein  28.94 
 
 
348 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>