24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1675 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  100 
 
 		 1153 aa  2367    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  32.94 
 
 		 954 aa  223  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  41.79 
 
 		 1320 aa  214  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  31.58 
 
 		 978 aa  204  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  39.84 
 
 		 1383 aa  194  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  32.08 
 
 		 1101 aa  151  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  29.7 
 
 		 1056 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1142 aa  128  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  29.08 
 
 		 818 aa  128  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  34.14 
 
 		 1031 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  32.54 
 
 		 926 aa  112  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  27.37 
 
 		 1107 aa  110  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  26.13 
 
 		 1171 aa  109  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  26.22 
 
 		 816 aa  102  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  28.31 
 
 		 818 aa  100  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  27.15 
 
 		 1137 aa  97.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  27.01 
 
 		 825 aa  92.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  27.01 
 
 		 830 aa  92.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  30.34 
 
 		 818 aa  84.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  25.29 
 
 		 774 aa  79  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  26.42 
 
 		 828 aa  77.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  35.4 
 
 		 770 aa  62.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  32.17 
 
 		 773 aa  55.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5025  Patatin  25.81 
 
 		 563 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.155032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>