41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0068 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  99.41 
 
 
1425 bp  1949    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0068    100 
 
 
1605 bp  3182    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.616376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  99.5 
 
 
1425 bp  1957    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  99.5 
 
 
1425 bp  1957    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2454  xylulose kinase  100 
 
 
1578 bp  3128    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0620  carbohydrate kinase family protein  100 
 
 
1578 bp  3128    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.693869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  92.27 
 
 
1575 bp  1538    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  83.7 
 
 
1437 bp  123  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  88.57 
 
 
1467 bp  113  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  83.91 
 
 
1452 bp  107  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  82.33 
 
 
1452 bp  105  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  82.33 
 
 
1452 bp  105  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  83.52 
 
 
1512 bp  103  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  81.82 
 
 
1446 bp  101  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  85.12 
 
 
1521 bp  97.6  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  81.62 
 
 
1467 bp  93.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  86.59 
 
 
1425 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0468  hypothetical protein  100 
 
 
1542 bp  60  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101632  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  96.55 
 
 
1689 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  96.55 
 
 
1689 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  91.89 
 
 
1443 bp  50.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  96.55 
 
 
1689 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  96.55 
 
 
1689 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  96.55 
 
 
1689 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  96.55 
 
 
1689 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  96.55 
 
 
1689 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  96.55 
 
 
1689 bp  50.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  96.55 
 
 
525 bp  50.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 
744 bp  50.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.75 
 
 
1833 bp  48.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  93.75 
 
 
756 bp  48.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8654  hypothetical protein  96.43 
 
 
474 bp  48.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  93.75 
 
 
756 bp  48.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  93.75 
 
 
756 bp  48.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1836 bp  48.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  100 
 
 
1398 bp  48.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  88.64 
 
 
1482 bp  48.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  88.64 
 
 
1482 bp  48.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
1506 bp  48.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452647 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  100 
 
 
1836 bp  48.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1836 bp  48.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>