68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0291 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0291  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  35.05 
 
 
207 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  35.38 
 
 
207 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  35.38 
 
 
207 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  35.38 
 
 
207 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  35.38 
 
 
207 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  35.38 
 
 
207 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  35.38 
 
 
207 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  35.38 
 
 
207 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  35.38 
 
 
207 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  35.38 
 
 
207 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2070  outer membrane lipoprotein LolB  36.1 
 
 
206 aa  154  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00533994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2409  outer membrane lipoprotein LolB  37.25 
 
 
207 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  35.15 
 
 
203 aa  151  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2116  outer membrane lipoprotein LolB  36.76 
 
 
207 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  33.96 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  33.96 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  33.96 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  33.96 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  35.05 
 
 
206 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  33.96 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  37.28 
 
 
207 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  37.87 
 
 
207 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  37.87 
 
 
207 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  30.11 
 
 
211 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  24.31 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  26.67 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0998  outer membrane lipoprotein LolB  23.33 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004205  outer membrane lipoprotein LolB precursor  23.2 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000360033  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  25.6 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  25.6 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  23.23 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  23.03 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0913  outer membrane lipoprotein LolB  23.35 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  23.79 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  23.79 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  22.75 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2565  outer membrane lipoprotein LolB  24.87 
 
 
218 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  20.66 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  23.53 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  21.82 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  22.71 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0918  outer membrane lipoprotein LolB  20.75 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.126701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  25.17 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  23.21 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  18.13 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3555  putative outer membrane lipoprotein LolB  23.46 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.460457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  19.9 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2914  outer membrane lipoprotein LolB  22 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000324286  normal  0.441694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  21.84 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  21.84 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  21.57 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  21.36 
 
 
205 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  21.84 
 
 
205 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  21.36 
 
 
205 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  27.54 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  21.6 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  21.95 
 
 
192 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0721  outer membrane lipoprotein LolB  22 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0885014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  17.76 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  20.85 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  23.67 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  20.29 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  23.08 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  20.29 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  21.36 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  22.33 
 
 
190 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>