More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3812 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  84.26 
 
 		 202 aa  322  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  87.43 
 
 		 202 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  74.73 
 
 		 195 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  75.53 
 
 		 198 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  75.13 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  74.6 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  59.54 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  57.41 
 
 		 189 aa  200  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  52.63 
 
 		 191 aa  194  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  52.33 
 
 		 192 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  54.94 
 
 		 189 aa  194  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  53.01 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  51.3 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  54.32 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  55.42 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  55.56 
 
 		 191 aa  191  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  55.15 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  56.36 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  51.87 
 
 		 190 aa  188  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  51.87 
 
 		 190 aa  188  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  54.88 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  55.15 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  57.67 
 
 		 189 aa  177  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  55.62 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  55.62 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  51.97 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  55 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  51.81 
 
 		 188 aa  175  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  57.06 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  48.51 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  55 
 
 		 211 aa  171  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  55 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  51.25 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  50.61 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  51.25 
 
 		 186 aa  165  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  56.85 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  53.42 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  47.4 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 199 aa  154  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  48.12 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  46.9 
 
 		 148 aa  121  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  38.1 
 
 		 149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.69 
 
 		 149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 153 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2453  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0207068  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0783  50S ribosomal protein L9  38.2 
 
 		 184 aa  108  8.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1310  50S ribosomal protein L9  40.3 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2566  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3213  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  42.76 
 
 		 148 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  43.28 
 
 		 150 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0005  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1892  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1401  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2413  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.209378  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2288  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1165  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1789  50S ribosomal protein L9  43.28 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.118839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2182  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.918152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1976  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.391403  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1231  50S ribosomal protein L9  42.65 
 
 		 150 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662893  normal  0.0262623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1529  50S ribosomal protein L9P  42.54 
 
 		 150 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00288476  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 149 aa  101  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0984  50S ribosomal protein L9  38.97 
 
 		 150 aa  101  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 147 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 147 aa  101  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 147 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2003  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 149 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2443  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 148 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0060  ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 160 aa  100  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.356425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2820  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 148 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>