More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0783 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0783  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
184 aa  366  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0693  50S ribosomal protein L9  50.59 
 
 
208 aa  169  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.389389  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0310  50S ribosomal protein L9  48.89 
 
 
208 aa  164  5e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  44.67 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  40.33 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  42.14 
 
 
189 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  41.51 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  39.33 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  41.51 
 
 
189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  37.57 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 
209 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  40.12 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  39.47 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  37.87 
 
 
197 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 
147 aa  111  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  40.76 
 
 
202 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 
189 aa  110  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
149 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  37.36 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 
189 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2820  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2443  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389118 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 
211 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  44.85 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
148 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
151 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
194 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
189 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  37.5 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  38.22 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
204 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
202 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  38.99 
 
 
191 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 
170 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  39.35 
 
 
195 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 
189 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
150 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
150 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 
150 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  39.16 
 
 
166 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
150 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
150 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
150 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
150 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
150 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  37.11 
 
 
191 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
149 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 
192 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 
192 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  38.99 
 
 
189 aa  104  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  41.38 
 
 
147 aa  104  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  37.28 
 
 
196 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
148 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
150 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  39.04 
 
 
148 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  39.04 
 
 
149 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3462  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
147 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
149 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
199 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  38 
 
 
150 aa  101  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40 
 
 
147 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
147 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
147 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  36.69 
 
 
194 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1084  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 
152 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00450273  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
147 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0060  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.356425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
148 aa  99  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
150 aa  99  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0930  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
154 aa  99.4  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  38.26 
 
 
150 aa  99  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
150 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  38.41 
 
 
152 aa  98.2  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
149 aa  97.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  36.24 
 
 
149 aa  97.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  40.67 
 
 
149 aa  97.1  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  39.04 
 
 
148 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2453  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
150 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0207068  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  36.99 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 
149 aa  97.1  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0431  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.740321 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
149 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  38 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
150 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0423  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
150 aa  95.9  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  40.3 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 
151 aa  94.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  36.77 
 
 
167 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  94.4  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>