204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1642 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  78.63 
 
 		 134 aa  185  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  76.99 
 
 		 116 aa  175  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  69.77 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  56.44 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  55.34 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  57.28 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  57.28 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  49.57 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  49.02 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  57.66 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  49.02 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  51.49 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  46.81 
 
 		 272 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 276 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  47.75 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  55.91 
 
 		 177 aa  87.8  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  49.53 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  57.47 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  42.53 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  41.57 
 
 		 263 aa  80.5  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  40.43 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  40.66 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  39 
 
 		 268 aa  77.4  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  34.95 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  39.36 
 
 		 270 aa  76.6  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 263 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  37.04 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  38.61 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  40 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  38.64 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  42.86 
 
 		 263 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 270 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  38.64 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  42.27 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  45.68 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  44.05 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  45.12 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  48 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  48 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  48 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  48 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  39 
 
 		 269 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  52 
 
 		 252 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  44 
 
 		 254 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  47.44 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  44 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  44.3 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  32.98 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  37.08 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  52 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  45.57 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 254 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  38.96 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  44 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  55 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 269 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  43.04 
 
 		 269 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  49.3 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  43.33 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  32.69 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  40.4 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.18 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  40.59 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  40.59 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  32.32 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  39 
 
 		 259 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 259 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>