More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1358 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  219  9e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  72.82 
 
 
107 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  72.82 
 
 
107 aa  167  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  72.82 
 
 
107 aa  167  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  69.61 
 
 
106 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  62.26 
 
 
107 aa  147  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  65.38 
 
 
107 aa  147  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  66.67 
 
 
106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  65.69 
 
 
106 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  57.28 
 
 
107 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  57.28 
 
 
107 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  59.22 
 
 
108 aa  140  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  57.84 
 
 
107 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  56.31 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  56.31 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  56.31 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  59.22 
 
 
108 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  53.77 
 
 
107 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  55.88 
 
 
106 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  59.22 
 
 
108 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  51.89 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  56.86 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  57.28 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  55.34 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  56.86 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  56.86 
 
 
108 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  56.7 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  56.86 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  56.86 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  53.4 
 
 
112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  53.4 
 
 
108 aa  130  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  53.92 
 
 
110 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  56.86 
 
 
106 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  56.86 
 
 
106 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  52.94 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  55.34 
 
 
108 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  53.4 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  52.43 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  54.72 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  58.59 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  58.59 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  54.46 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  56.86 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  58.59 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  58.59 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  54.37 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  53.4 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  54.37 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  52.94 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  54.37 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  57.58 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  56.57 
 
 
108 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  56.57 
 
 
108 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  56.57 
 
 
108 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  56.57 
 
 
108 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  52.83 
 
 
106 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  52.83 
 
 
106 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  51.46 
 
 
109 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  49.06 
 
 
106 aa  126  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  55.34 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  54.37 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  55.34 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  55.34 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  52.53 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  51.96 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>