33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0073 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  52 
 
 		 266 aa  241  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.03 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.82 
 
 		 279 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  27.2 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.31 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.69 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.82 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  24.79 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.5 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  24.28 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.29 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.16 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  24.6 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.31 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.31 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.31 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.08 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.71 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  24.4 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3578  putative gas vesicle synthesis protein  27.17 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3262  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.78 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.33 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.24 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0335  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.82 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.69 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.11 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.4 
 
 		 316 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.11 
 
 		 357 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1007  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  18.52 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  25.19 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3023  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.34 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>