68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1925 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1925  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0924  hypothetical protein  36.4 
 
 
251 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000208193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05000  hypothetical protein  40.64 
 
 
247 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0406  hypothetical protein  35.66 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000345216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0349  hypothetical protein  32.79 
 
 
243 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2638  hypothetical protein  31.71 
 
 
245 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0321  hypothetical protein  31.33 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1725  hypothetical protein  34.43 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.290957  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0247  hypothetical protein  31.98 
 
 
245 aa  138  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0125  hypothetical protein  32.65 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.212307  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3381  hypothetical protein  31.05 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1941  hypothetical protein  30.49 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0307  hypothetical protein  34.41 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00166335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1283  hypothetical protein  31.3 
 
 
249 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3328  hypothetical protein  30.08 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1574  hypothetical protein  27.64 
 
 
243 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.235468  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0227  hypothetical protein  30.4 
 
 
252 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0221603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0193  hypothetical protein  29.96 
 
 
254 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.125888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3694  hypothetical protein  29.63 
 
 
270 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0109  hypothetical protein  27.82 
 
 
249 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1203  hypothetical protein  29.73 
 
 
255 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0634007  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0175  hypothetical protein  33.08 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12073  hypothetical protein  31.75 
 
 
258 aa  108  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.793461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0664  hypothetical protein  30.28 
 
 
247 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0392  hypothetical protein  33.75 
 
 
232 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0101615  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15340  hypothetical protein  26.12 
 
 
258 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00498288  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1153  hypothetical protein  23.33 
 
 
302 aa  95.9  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.419264  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4057  hypothetical protein  27.49 
 
 
256 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  normal  0.100752 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1788  hypothetical protein  24.9 
 
 
283 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0825  hypothetical protein  23.57 
 
 
294 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.246214  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09120  hypothetical protein  23.87 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.039134  normal  0.507891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0819  hypothetical protein  27.86 
 
 
280 aa  89.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1156  hypothetical protein  24.7 
 
 
243 aa  82  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00259628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.09 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  23.77 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.15 
 
 
484 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  28.9 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.76 
 
 
484 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.66 
 
 
479 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.51 
 
 
493 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.04 
 
 
465 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.11 
 
 
485 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  24.21 
 
 
485 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  26.74 
 
 
485 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  28.47 
 
 
496 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  23.94 
 
 
285 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  22.92 
 
 
495 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  22.87 
 
 
282 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.71 
 
 
480 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.1 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  23.4 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.75 
 
 
485 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  28.57 
 
 
474 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.47 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  30.37 
 
 
492 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  21.84 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.57 
 
 
485 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  25.3 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  23.57 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.14 
 
 
491 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  21.47 
 
 
279 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0495  hypothetical protein  21.5 
 
 
346 aa  49.3  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  25.3 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  23.86 
 
 
477 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  22.08 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.83 
 
 
490 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  23.71 
 
 
476 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  24.47 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>