239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2131 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  66.53 
 
 
545 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  65.7 
 
 
526 aa  640    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  93.24 
 
 
518 aa  985    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  63.87 
 
 
567 aa  635    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  67.74 
 
 
526 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1046    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  63.87 
 
 
567 aa  635    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  63.87 
 
 
567 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  64.92 
 
 
553 aa  634  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  62.58 
 
 
544 aa  632  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  61.71 
 
 
519 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  63.62 
 
 
606 aa  625  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  68.12 
 
 
544 aa  621  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  64.52 
 
 
552 aa  617  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  62.29 
 
 
553 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  59.8 
 
 
551 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  52.18 
 
 
501 aa  509  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  58.03 
 
 
539 aa  508  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  51.91 
 
 
473 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  52.79 
 
 
488 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  54.27 
 
 
488 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  52.14 
 
 
476 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  51.26 
 
 
487 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  52.58 
 
 
480 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  51.26 
 
 
489 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  52.24 
 
 
472 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  50.32 
 
 
479 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  51.81 
 
 
472 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  50.21 
 
 
480 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  50 
 
 
480 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  53.04 
 
 
489 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  50.43 
 
 
480 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  48.45 
 
 
482 aa  488  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  51.92 
 
 
476 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  48.45 
 
 
481 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  52.03 
 
 
472 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  51.81 
 
 
472 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  50.95 
 
 
478 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  49.89 
 
 
479 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  51.91 
 
 
480 aa  480  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  51.48 
 
 
477 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  51.72 
 
 
471 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  50.11 
 
 
477 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  50.95 
 
 
479 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  48.77 
 
 
482 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  50.11 
 
 
492 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  51.72 
 
 
471 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  50.21 
 
 
518 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  50.75 
 
 
494 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  47.22 
 
 
482 aa  472  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  52.14 
 
 
469 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  54.86 
 
 
479 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  49.07 
 
 
498 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  52.35 
 
 
469 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  48.35 
 
 
482 aa  475  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  51.82 
 
 
470 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  46.6 
 
 
482 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  50.52 
 
 
518 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  47.01 
 
 
482 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  51.6 
 
 
476 aa  475  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  55.09 
 
 
479 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  52.14 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  51.39 
 
 
469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  51.84 
 
 
494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  51.39 
 
 
470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  49.39 
 
 
497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  51.84 
 
 
494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  51.81 
 
 
472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  52.24 
 
 
489 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  51.28 
 
 
507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  51.18 
 
 
469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  50.32 
 
 
479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  51.17 
 
 
482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  52 
 
 
472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  51.09 
 
 
507 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  50.96 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  53.91 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  49.59 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  46.9 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  50.21 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  49.59 
 
 
515 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  46.38 
 
 
488 aa  465  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1668  protein of unknown function DUF404  54.01 
 
 
508 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.325623  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  47.11 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  49.48 
 
 
485 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  46.69 
 
 
480 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  50.43 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  50.32 
 
 
477 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  49.38 
 
 
488 aa  464  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  49.25 
 
 
469 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  49.89 
 
 
491 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  50.11 
 
 
486 aa  465  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  49.68 
 
 
479 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  49.68 
 
 
479 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  51.17 
 
 
472 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  49.57 
 
 
486 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  53.71 
 
 
490 aa  465  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  50.32 
 
 
478 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  50.32 
 
 
478 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  50.32 
 
 
478 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>