37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0010 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  869    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  30.69 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  31.89 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  27.29 
 
 		 517 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  31.7 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  28.64 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  28.24 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  27.53 
 
 		 421 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  30.61 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  27.91 
 
 		 406 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  29.11 
 
 		 485 aa  153  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  25.1 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  30.12 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  30.52 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.68 
 
 		 521 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.02 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  29.86 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  23.25 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.81 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  29.88 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  27.34 
 
 		 517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.48 
 
 		 540 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  26.85 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  30.45 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  28.36 
 
 		 322 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  27.72 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.32 
 
 		 316 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  77.8  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  25.86 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2668  Domain of unknown function DUF1858  30.43 
 
 		 74 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1604  hypothetical protein  26.09 
 
 		 75 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.334273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  25 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  24 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.12 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  25.57 
 
 		 227 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>