37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0010 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  869  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  4.57156e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  30.69 
 
 
532 aa  232  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  31.89 
 
 
411 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  27.29 
 
 
517 aa  185  1e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  31.7 
 
 
407 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  7.06509e-09  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 
395 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  28.64 
 
 
410 aa  165  1e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.66849e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  28.24 
 
 
415 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  27.53 
 
 
421 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  30.61 
 
 
398 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  27.91 
 
 
406 aa  157  5e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  29.11 
 
 
485 aa  153  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  25.1 
 
 
491 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  30.12 
 
 
433 aa  149  1e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  5.24256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  30.52 
 
 
433 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.02 
 
 
398 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.68 
 
 
521 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  29.86 
 
 
432 aa  140  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  23.25 
 
 
536 aa  135  2e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.81 
 
 
342 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  29.88 
 
 
391 aa  116  8e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  27.34 
 
 
517 aa  115  1e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.48 
 
 
540 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  26.85 
 
 
438 aa  114  4e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  30.45 
 
 
321 aa  113  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  28.36 
 
 
322 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  27.72 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.32 
 
 
316 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  35.29 
 
 
140 aa  77.8  4e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  7.76425e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  31.45 
 
 
416 aa  77.4  5e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.39902e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  25.86 
 
 
148 aa  60.5  6e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.89028e-06  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2668  Domain of unknown function DUF1858  30.43 
 
 
74 aa  50.8  5e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1604  hypothetical protein  26.09 
 
 
75 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.334273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  25 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  24 
 
 
411 aa  43.9  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.12 
 
 
459 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.60791e-13  unclonable  4.10956e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  25.57 
 
 
227 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.41633e-11  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>