More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1333 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1333  histidine kinase  100 
 
 
226 aa  465  1e-130  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000137869  decreased coverage  0.000238136 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1045  histidine kinase  74.09 
 
 
457 aa  352  2e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00270  signal transduction histidine kinase  66.36 
 
 
447 aa  307  7e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  2.30413e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  54.02 
 
 
418 aa  243  2e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  49.09 
 
 
494 aa  215  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  43.46 
 
 
397 aa  194  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  38.99 
 
 
497 aa  172  3e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
479 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
429 aa  151  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
491 aa  147  1e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0736  histidine kinase  35.02 
 
 
508 aa  143  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
585 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
469 aa  140  2e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
465 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  38.01 
 
 
506 aa  138  8e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  37.73 
 
 
452 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  36.2 
 
 
452 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  37.73 
 
 
452 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  37.73 
 
 
452 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59122e-27 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  37.96 
 
 
483 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  35.4 
 
 
481 aa  135  3e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  4.23782e-09 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
365 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
384 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
425 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  35.78 
 
 
486 aa  135  7e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
474 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  38.18 
 
 
470 aa  134  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  35.27 
 
 
471 aa  134  1e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  33.93 
 
 
471 aa  134  1e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
513 aa  134  1e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.0063e-06  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
471 aa  133  2e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  38.53 
 
 
477 aa  134  2e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  32.88 
 
 
472 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
515 aa  132  4e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  4.93136e-06 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  34.82 
 
 
490 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  2.98579e-06  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  37.04 
 
 
477 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
423 aa  132  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
366 aa  131  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
475 aa  130  1e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  37.91 
 
 
369 aa  130  2e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
470 aa  130  2e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
534 aa  130  2e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  38.53 
 
 
471 aa  130  2e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
509 aa  130  2e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
509 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
589 aa  129  4e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  35.68 
 
 
527 aa  128  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  34.1 
 
 
456 aa  128  8e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  38.6 
 
 
497 aa  127  1e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  34.51 
 
 
451 aa  127  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
612 aa  127  1e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  35.14 
 
 
520 aa  127  1e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
451 aa  127  1e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
479 aa  127  1e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1624  sensor histidine kinase CsrS  33.93 
 
 
501 aa  126  2e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0265731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
529 aa  126  2e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
504 aa  127  2e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
469 aa  126  2e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
475 aa  125  4e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.39 
 
 
477 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
403 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
552 aa  124  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
587 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
433 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
815 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
592 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.1549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
582 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  35.81 
 
 
477 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  31.22 
 
 
416 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
524 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  30.63 
 
 
587 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
522 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
611 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  30.63 
 
 
587 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.10325e-07 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  30.8 
 
 
412 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  31.56 
 
 
613 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
600 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  31.56 
 
 
613 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
585 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
608 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  30.38 
 
 
416 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.22 
 
 
503 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  30.38 
 
 
416 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  37.95 
 
 
487 aa  120  1e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.8 
 
 
537 aa  120  1e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  31.56 
 
 
613 aa  120  1e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  31.56 
 
 
613 aa  120  1e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  31.56 
 
 
613 aa  120  1e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  31.56 
 
 
613 aa  120  1e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  31.65 
 
 
416 aa  121  1e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  30.18 
 
 
587 aa  121  1e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
418 aa  120  1e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
609 aa  120  1e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  31.11 
 
 
613 aa  120  2e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
535 aa  120  2e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  31.56 
 
 
613 aa  120  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
619 aa  120  2e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  30.18 
 
 
587 aa  120  2e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  32 
 
 
613 aa  120  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.19997e-07  hitchhiker  9.90225e-13 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  30.18 
 
 
587 aa  120  2e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>