More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1166 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  78.05 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 135 aa  197  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 135 aa  196  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  76.42 
 
 		 123 aa  196  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  195  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  76.42 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  193  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  193  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  76.86 
 
 		 134 aa  192  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  76.23 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  72.95 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  191  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  190  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  190  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 128 aa  190  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  190  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  189  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  189  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 133 aa  189  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  73.17 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  74.59 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 135 aa  189  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  70.23 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  73.55 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 126 aa  187  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  72.13 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  72.13 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  72.13 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2779  ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0598537  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  186  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  186  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  73.77 
 
 		 122 aa  186  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 127 aa  186  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  65.19 
 
 		 202 aa  185  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>