More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0107 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0107  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
182 aa  363  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.576089 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.67 
 
 
181 aa  223  8e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2897  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.12 
 
 
180 aa  223  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.54 
 
 
189 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.71 
 
 
180 aa  208  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02020  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.91 
 
 
199 aa  208  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.95 
 
 
182 aa  207  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.31 
 
 
183 aa  203  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
179 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
184 aa  200  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
190 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.07 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.25 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
180 aa  195  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
183 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.22 
 
 
180 aa  194  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 
176 aa  194  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.93 
 
 
184 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.02 
 
 
181 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.86 
 
 
179 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.86 
 
 
184 aa  191  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.41 
 
 
186 aa  191  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
183 aa  190  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 
181 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
179 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
179 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
180 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
183 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.18 
 
 
178 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
180 aa  185  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
183 aa  185  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.95 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0532  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.187289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  182  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
180 aa  181  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
190 aa  181  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
183 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0203  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
184 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.727257  normal  0.158525 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0149  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
179 aa  179  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4309  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
190 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4745  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
190 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.587694  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8427  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0061  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
181 aa  178  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
181 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.93 
 
 
682 aa  175  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.16 
 
 
180 aa  174  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0063  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 
175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0615  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
195 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.6 
 
 
608 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.4 
 
 
676 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.14 
 
 
183 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
174 aa  168  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.86 
 
 
222 aa  168  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0834  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
195 aa  167  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1847  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
187 aa  166  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
181 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
183 aa  165  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0403  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 
179 aa  165  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000407024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5377  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
194 aa  164  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
595 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3004  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
178 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0267  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.13 
 
 
180 aa  161  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
175 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0134  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
175 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0566  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
189 aa  160  9e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0161542  hitchhiker  0.00589759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
184 aa  160  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0556  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
188 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
174 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1323  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
176 aa  160  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
177 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2752  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
176 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.567949  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1606  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.98 
 
 
180 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1412  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
191 aa  157  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
473 aa  157  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00597549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35700  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
184 aa  157  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.175987  normal  0.670419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0131  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
175 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0706154  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0677  putative GAF sensor protein  45.24 
 
 
466 aa  155  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000194317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
172 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1588  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
175 aa  156  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
224 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.24 
 
 
187 aa  155  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0749  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00900087  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0187  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.54 
 
 
186 aa  154  8e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>