188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2111 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
215 aa  439  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.49 
 
 
292 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.65 
 
 
209 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.43 
 
 
243 aa  101  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0420468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  33.55 
 
 
344 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  34.04 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  31.68 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  34.04 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  30.92 
 
 
330 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  32.62 
 
 
520 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  31.91 
 
 
575 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  33.09 
 
 
493 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  30.56 
 
 
588 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  32.62 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  32.24 
 
 
349 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  28.47 
 
 
568 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  31.21 
 
 
537 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  30.34 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  31.11 
 
 
519 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  33.33 
 
 
455 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  31.85 
 
 
503 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  32.59 
 
 
520 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  31.11 
 
 
496 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  30.37 
 
 
536 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  31.88 
 
 
411 aa  65.1  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  28.99 
 
 
419 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  30.43 
 
 
418 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.19 
 
 
257 aa  62  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28 
 
 
376 aa  61.6  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.37 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.81 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 
397 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.39 
 
 
250 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2270  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.56 
 
 
321 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0010326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.5 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.87 
 
 
398 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24.56 
 
 
321 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00392784  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.65 
 
 
370 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2191  hypothetical protein  29.05 
 
 
309 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2350  hypothetical protein  29.05 
 
 
309 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00214407  hitchhiker  0.00290758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.35 
 
 
318 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000497106  hitchhiker  9.91148e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2137  hypothetical protein  29.05 
 
 
309 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2237  hypothetical protein  29.05 
 
 
309 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.485694  normal  0.208005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2184  hypothetical protein  29.05 
 
 
309 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295088  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.67 
 
 
142 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.24 
 
 
292 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.93 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.82 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.91 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0905  hypothetical protein  33.57 
 
 
306 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0968  hypothetical protein  33.57 
 
 
306 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0989  hypothetical protein  33.57 
 
 
306 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.800938  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0935  hypothetical protein  33.57 
 
 
306 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.22 
 
 
374 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0877  hypothetical protein  33.57 
 
 
306 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.2 
 
 
294 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.17 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0448  hypothetical protein  29.86 
 
 
315 aa  52.4  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2113  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.00781e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0968  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  52.4  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1638  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.383508  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1134  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258795  hitchhiker  0.0000968229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2272  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000409269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0598  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.98 
 
 
306 aa  52  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1922  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.02 
 
 
325 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395353  unclonable  2.80385e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01899  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  27.89 
 
 
310 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.89 
 
 
311 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00191568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01888  hypothetical protein  27.89 
 
 
310 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2835  hypothetical protein  27.89 
 
 
311 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  normal  0.833391 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.23 
 
 
291 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1762  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.54 
 
 
325 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000230902  hitchhiker  0.000000000000707546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.93 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.16 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00786  hypothetical protein  30.41 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.41 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.75 
 
 
411 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  21.99 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.16 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0968  hypothetical protein  32.14 
 
 
304 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.495532  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00803  hypothetical protein  30.41 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2529  hypothetical protein  30.41 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.990181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2824  hypothetical protein  30.41 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.08 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1310  hypothetical protein  32.14 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.17 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
396 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0843  hypothetical protein  30.41 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0876  hypothetical protein  30.41 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0889  hypothetical protein  30.41 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.479275  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.08 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.08 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.48 
 
 
142 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.61 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23090  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.19 
 
 
317 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00352469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.24 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3357  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.75 
 
 
358 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0695  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.39 
 
 
356 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.58 
 
 
155 aa  48.9  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.12 
 
 
190 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>