More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6828 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  78.99 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  80.8 
 
 		 279 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  78.99 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  78.62 
 
 		 277 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  78.99 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  77.9 
 
 		 277 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  77.01 
 
 		 275 aa  461  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  78.49 
 
 		 279 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  78.62 
 
 		 275 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  76.95 
 
 		 282 aa  454  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  77.17 
 
 		 277 aa  451  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  76.24 
 
 		 301 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  76.81 
 
 		 277 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  76.81 
 
 		 277 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  77.17 
 
 		 281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  74.02 
 
 		 283 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  73.48 
 
 		 279 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  77.06 
 
 		 279 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  72.95 
 
 		 282 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  74.19 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  71.68 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  72.14 
 
 		 287 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  71.94 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  71.38 
 
 		 277 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  71.01 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  58.91 
 
 		 280 aa  329  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  56.36 
 
 		 288 aa  328  7e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  51.81 
 
 		 281 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  51.81 
 
 		 281 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  55.2 
 
 		 297 aa  298  8e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  53.24 
 
 		 289 aa  298  9e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  54.32 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  51.81 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  55.04 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  52 
 
 		 286 aa  295  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  53.48 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  52.94 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  50.9 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  49.11 
 
 		 285 aa  285  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  52.67 
 
 		 297 aa  284  9e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  52.77 
 
 		 321 aa  283  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  51.28 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  53.24 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  53.24 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  49.12 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  49.82 
 
 		 297 aa  278  7e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  48.38 
 
 		 281 aa  276  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  48.71 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  51.26 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  48.71 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  48.9 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  48.9 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  48.9 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  48.78 
 
 		 304 aa  271  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  49.45 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  48.74 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 355 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  50.9 
 
 		 307 aa  268  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  51.36 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  48.34 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  49.13 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  48.53 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  46.24 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  46.1 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  45.91 
 
 		 285 aa  248  6e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  44.98 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  46.37 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  44.48 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 366 aa  208  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  40.37 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  37.09 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  32.5 
 
 		 282 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  30.8 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  35.25 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  29.17 
 
 		 477 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.38 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  28.32 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  31.56 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.37 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.07 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  30.79 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  35.92 
 
 		 327 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.76 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  30.98 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.74 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  30.28 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.33 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.01 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>