More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6609 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  79.2 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  72.73 
 
 		 139 aa  176  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  71.43 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  71.17 
 
 		 136 aa  164  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  69.57 
 
 		 136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  73.91 
 
 		 125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  75.23 
 
 		 117 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  73.21 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  73.21 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  63.24 
 
 		 158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  75.24 
 
 		 125 aa  157  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  65.85 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  73.33 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  64.52 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  67.83 
 
 		 281 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  67.8 
 
 		 197 aa  144  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  66.98 
 
 		 114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  66.67 
 
 		 125 aa  143  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  63.33 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  59.48 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  62.5 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  64.46 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  58.33 
 
 		 121 aa  137  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  62.86 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  57.41 
 
 		 113 aa  137  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  59.68 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  58.33 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  62.39 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  61.34 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  62.28 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  52.59 
 
 		 128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  62.14 
 
 		 117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  53.91 
 
 		 128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  62.73 
 
 		 122 aa  133  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  61.32 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1045  50S ribosomal protein L22  64.91 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1018  50S ribosomal protein L22  64.91 
 
 		 177 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1035  50S ribosomal protein L22  64.91 
 
 		 177 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  60.91 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  51.3 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  59.09 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  62.14 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 113 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  62.14 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  62.14 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  62.14 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  54.21 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  59.63 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  54.21 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  55.66 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  60.38 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  56.88 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  60.95 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  56.88 
 
 		 113 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  54.95 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1960  50S ribosomal protein L22  53.4 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0936  ribosomal protein L22  60.17 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16731  50S ribosomal protein L22  45.24 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  57.55 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  57.28 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  58.49 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  49.57 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  57.14 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  60 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  53.7 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  60.38 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>