63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6301 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6301  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  100 
 
 
223 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0478  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0105  aminoglycoside phosphotransferase  40.37 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0679113  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3734  aminoglycoside phosphotransferase  45.57 
 
 
213 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4730  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 
216 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6367  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  24.46 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  25.13 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1926  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
284 aa  59.3  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00274282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  24.46 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  25.95 
 
 
268 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0353  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.687615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  22.68 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07750  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  33.53 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.79134  normal  0.0827875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  24.73 
 
 
261 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 
308 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 
303 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  23.37 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  29.52 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  28.14 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0655  metalloendopeptidase, glycoprotease family  28.57 
 
 
530 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  29.22 
 
 
295 aa  49.3  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  29.22 
 
 
288 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  29.22 
 
 
288 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 
331 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  31.69 
 
 
329 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  23.5 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0048  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000121913  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 
603 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 
331 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  31.75 
 
 
583 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  28.9 
 
 
316 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  41.18 
 
 
294 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0424  aminoglycoside phosphotransferase  23.03 
 
 
249 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  28.91 
 
 
566 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
754 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  34.55 
 
 
323 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
542 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1195  O-sialoglycoprotein endopeptidase  25.93 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.112433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.47 
 
 
599 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  40.35 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
421 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
664 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  42 
 
 
274 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  27.87 
 
 
337 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  27.96 
 
 
297 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
587 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
481 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  30.67 
 
 
297 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
870 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
590 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.82 
 
 
1194 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  30.28 
 
 
288 aa  42.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.82 
 
 
687 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 
571 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  37.66 
 
 
289 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1295  hypothetical protein  25 
 
 
485 aa  42  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  26.42 
 
 
264 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 
519 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2322  aminoglycoside phosphotransferase, N-terminal region  29.58 
 
 
109 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00287241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>