More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0074 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  100 
 
 
115 aa  227  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  60.91 
 
 
109 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  61.32 
 
 
110 aa  127  7e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  62.64 
 
 
107 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  64.29 
 
 
113 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  61.62 
 
 
110 aa  120  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  58.49 
 
 
110 aa  119  1e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  61.4 
 
 
118 aa  116  8e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  51.92 
 
 
113 aa  113  9e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  59.41 
 
 
115 aa  112  1e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  57.78 
 
 
108 aa  111  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  60.2 
 
 
107 aa  109  1e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  57.43 
 
 
112 aa  109  1e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  50.91 
 
 
113 aa  109  1e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  7.73759e-05  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  51.92 
 
 
116 aa  108  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  51.92 
 
 
116 aa  108  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  50.91 
 
 
116 aa  108  2e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  52.88 
 
 
116 aa  108  2e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  57 
 
 
111 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  49.52 
 
 
107 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  53 
 
 
108 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  55.56 
 
 
116 aa  100  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  56.57 
 
 
111 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  50.51 
 
 
108 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  51.49 
 
 
111 aa  98.6  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  45.79 
 
 
108 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  44.76 
 
 
117 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  52.81 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  44.12 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
113 aa  87  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  48.24 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  47.56 
 
 
145 aa  82  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  49.41 
 
 
471 aa  79.3  2e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  43.43 
 
 
105 aa  77  7e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  41.94 
 
 
98 aa  77  7e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.75905e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
269 aa  76.6  9e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  9.17613e-09 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1847  rhodanese domain-containing protein  46.75 
 
 
103 aa  75.9  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0832695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1812  rhodanese domain-containing protein  46.75 
 
 
103 aa  75.9  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  51.85 
 
 
356 aa  75.9  2e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 
98 aa  75.5  2e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  44.05 
 
 
170 aa  75.9  2e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  51.85 
 
 
356 aa  75.9  2e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  39.73 
 
 
100 aa  75.9  2e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  48.05 
 
 
189 aa  75.1  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  51.85 
 
 
356 aa  74.7  4e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 
220 aa  74.7  4e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 
110 aa  74.7  4e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 
127 aa  74.3  5e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  45.12 
 
 
123 aa  73.9  6e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  39.74 
 
 
97 aa  73.6  8e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  2.45472e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  46.58 
 
 
98 aa  73.2  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  49.37 
 
 
98 aa  72  2e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  50.62 
 
 
356 aa  71.6  3e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 
98 aa  71.6  3e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  40.78 
 
 
142 aa  71.6  3e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  45.45 
 
 
103 aa  71.6  4e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 
108 aa  71.2  4e-12  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  40.26 
 
 
127 aa  71.2  5e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  40.26 
 
 
127 aa  71.2  5e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  40.26 
 
 
127 aa  71.2  5e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  40.26 
 
 
127 aa  71.2  5e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  40.26 
 
 
127 aa  71.2  5e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  40.26 
 
 
127 aa  71.2  5e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  40.26 
 
 
127 aa  71.2  5e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  42.39 
 
 
129 aa  70.9  6e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  36.96 
 
 
547 aa  70.9  6e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 
127 aa  70.9  6e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  37.66 
 
 
127 aa  70.9  6e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  44.87 
 
 
189 aa  70.9  6e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.44688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
216 aa  70.5  7e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  41.49 
 
 
114 aa  70.5  8e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 
356 aa  70.1  9e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 
124 aa  70.1  9e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  38.96 
 
 
127 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  49.38 
 
 
356 aa  70.1  1e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  48.15 
 
 
356 aa  70.1  1e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 
98 aa  69.7  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 
194 aa  69.7  1e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 
141 aa  69.3  2e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  38.96 
 
 
127 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 
137 aa  69.3  2e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  7.89559e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
103 aa  68.6  3e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 
124 aa  68.2  3e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  41.03 
 
 
106 aa  68.2  4e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.25485e-07 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  40.48 
 
 
132 aa  68.2  4e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  39.51 
 
 
98 aa  67.8  5e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  39.51 
 
 
98 aa  67.8  5e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  39.51 
 
 
98 aa  67.8  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  39.51 
 
 
98 aa  67.8  5e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.77114e-15 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.99 
 
 
383 aa  67.4  6e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 
122 aa  67.4  6e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  37.25 
 
 
138 aa  67.4  6e-11  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 
130 aa  67  7e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
109 aa  67  8e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 
112 aa  67  8e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 
113 aa  67  9e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.67 
 
 
817 aa  66.6  1e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.86256e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
113 aa  66.2  1e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  42.22 
 
 
147 aa  66.2  1e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  35.64 
 
 
101 aa  66.6  1e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>