More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1006 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
524 aa  993    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  35.21 
 
 
534 aa  220  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30.57 
 
 
502 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
519 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  28.42 
 
 
519 aa  194  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
527 aa  193  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  26.56 
 
 
521 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  28.88 
 
 
519 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  29.22 
 
 
570 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  27 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  29.29 
 
 
553 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  29.6 
 
 
502 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  29.35 
 
 
521 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  30.65 
 
 
523 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  27.91 
 
 
514 aa  176  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.74 
 
 
549 aa  176  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  28.04 
 
 
519 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  30.66 
 
 
513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  28.54 
 
 
544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  28.14 
 
 
545 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  28.14 
 
 
545 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  26.38 
 
 
550 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  29.15 
 
 
505 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  30.22 
 
 
532 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  28.99 
 
 
519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  29.09 
 
 
539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  25.93 
 
 
513 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  29.1 
 
 
501 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  31.03 
 
 
501 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  27.2 
 
 
507 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  31.41 
 
 
545 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  31.73 
 
 
505 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  29.53 
 
 
550 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  25.84 
 
 
506 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.29 
 
 
513 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  31.21 
 
 
548 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  31.26 
 
 
500 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  32.87 
 
 
511 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  24.63 
 
 
531 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  23.75 
 
 
531 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  27.31 
 
 
557 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.65 
 
 
544 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  24.53 
 
 
531 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.65 
 
 
544 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  24.63 
 
 
531 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  31.03 
 
 
500 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  28.96 
 
 
511 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  30.64 
 
 
507 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  27.98 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  29.79 
 
 
508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.39 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0999  Ppx/GppA phosphatase  33.22 
 
 
324 aa  134  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.39 
 
 
502 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  22.31 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  24.84 
 
 
497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3146  exopolyphosphatase, putative  33.55 
 
 
310 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236338  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3210  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 
305 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  30.22 
 
 
500 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  29.54 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  25.71 
 
 
321 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 
500 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  28.37 
 
 
506 aa  126  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  32.01 
 
 
526 aa  126  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.31 
 
 
500 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0657  Ppx/GppA phosphatase  32.48 
 
 
359 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  30.33 
 
 
501 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0664  Ppx/GppA phosphatase  32.48 
 
 
359 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0677  Ppx/GppA phosphatase  32.48 
 
 
359 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 
520 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  29.84 
 
 
500 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  29.44 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  27.73 
 
 
505 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  24.44 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  31.47 
 
 
512 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3078  Ppx/GppA phosphatase  25.7 
 
 
515 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  27.96 
 
 
508 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2012  Ppx/GppA phosphatase  32.89 
 
 
311 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  29.45 
 
 
312 aa  120  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  28.74 
 
 
499 aa  120  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  28.45 
 
 
506 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0079  Ppx/GppA phosphatase  28.41 
 
 
343 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  28.6 
 
 
511 aa  120  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5174  Ppx/GppA phosphatase  30.29 
 
 
298 aa  120  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985402  normal  0.0128836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  28.88 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  28.8 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  28.1 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  30.41 
 
 
497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  28.67 
 
 
526 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  29.23 
 
 
501 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  27.72 
 
 
520 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  25.21 
 
 
509 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0833  Ppx/GppA phosphatase  29.93 
 
 
355 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0398772  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0609  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 
326 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91513  normal  0.0958976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2106  Ppx/GppA phosphatase  24.42 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000089745  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24540  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 
314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10505  hypothetical protein  29.04 
 
 
344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0443339  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0656  Ppx/GppA phosphatase  30.49 
 
 
319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2012  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  26.3 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00809551  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02700  exopolyphosphatase  31.01 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>