120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0014 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
73 aa  145  2e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.27273e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  63.93 
 
 
79 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  54.41 
 
 
71 aa  80.9  5e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.94045e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  53.73 
 
 
71 aa  78.6  3e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  44.44 
 
 
75 aa  73.2  1e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  53.23 
 
 
69 aa  67.4  6e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  46.77 
 
 
68 aa  66.6  1e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 
89 aa  63.9  6e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 
74 aa  61.2  5e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  3.05628e-05 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  43.48 
 
 
89 aa  60.1  1e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
72 aa  59.3  2e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.20803e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  45.16 
 
 
70 aa  57.8  5e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  5.95514e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
74 aa  57.4  7e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 
82 aa  57  9e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  42.42 
 
 
77 aa  56.2  1e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  39.71 
 
 
69 aa  57  1e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1035  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 
75 aa  56.2  1e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 
71 aa  55.5  2e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  8.21993e-10  normal  0.249392 
 
 
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
82 aa  55.5  3e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
68 aa  55.5  3e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5711  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 
75 aa  55.5  3e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 
68 aa  55.5  3e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  37.5 
 
 
71 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 
71 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 
71 aa  54.7  4e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  37.5 
 
 
71 aa  54.7  4e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  38.1 
 
 
71 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  3.27322e-08 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  37.5 
 
 
71 aa  54.7  4e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  37.5 
 
 
71 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.35469e-10 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 
69 aa  54.7  5e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4237  putative transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 
84 aa  54.3  5e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 
69 aa  54.3  5e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0918  DNA-binding protein  37.88 
 
 
72 aa  54.7  5e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  44.78 
 
 
78 aa  54.3  5e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 
74 aa  54.3  6e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
72 aa  53.9  8e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0168  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
77 aa  53.1  1e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 
71 aa  53.1  1e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  36.36 
 
 
72 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  36.51 
 
 
71 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0418  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 
77 aa  52.8  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.588e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 
79 aa  52.8  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  36.51 
 
 
71 aa  52  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
74 aa  52  3e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  41.18 
 
 
70 aa  51.6  4e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 
106 aa  51.6  4e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 
71 aa  51.2  5e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18370  predicted transcriptional regulator  37.88 
 
 
78 aa  51.2  5e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.312817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
77 aa  51.2  5e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3592  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
68 aa  51.2  5e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
81 aa  51.2  5e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  36.36 
 
 
76 aa  51.2  5e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 
74 aa  51.2  5e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
75 aa  50.8  6e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  37.93 
 
 
76 aa  50.8  7e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 
68 aa  50.4  7e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 
68 aa  50.4  7e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
74 aa  50.4  7e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0086  hypothetical protein  38.67 
 
 
111 aa  50.4  8e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.417163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4238  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
69 aa  50.4  8e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
70 aa  50.1  9e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3131  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
67 aa  48.9  2e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 
73 aa  49.3  2e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
71 aa  49.3  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
74 aa  48.9  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4401  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
76 aa  49.3  2e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748815  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05290  predicted transcriptional regulator  36.23 
 
 
85 aa  48.9  2e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2888  putative transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
93 aa  48.1  4e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
82 aa  48.1  4e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2988  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 
74 aa  47.8  5e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.962229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
70 aa  47.8  6e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3008  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
76 aa  47.4  7e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
74 aa  47.4  7e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1981  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
68 aa  47.4  7e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4120  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
80 aa  47  8e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424691  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3870  transcriptional regulator, XRE family protein  39.06 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  32.84 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.656945  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2707  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3957  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
94 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010777  normal  0.26793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0937  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.792674  normal  0.0631359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  33.33 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3478  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0540861  normal  0.173042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3598  helix-turn-helix type 3  37.88 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1830  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2665  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0028  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1336  hypothetical protein  35.71 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.94784  normal  0.842689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0844  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2300  putative transcriptional regulatory protein  37.1 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2135  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1440  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8816  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809895  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2169  hypothetical protein  37.1 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0666173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0924  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.385099  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>