56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0418 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0418  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 77 aa  157  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2853  putative transcriptional regulator, XRE family  55.84 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1322  hypothetical protein  51.95 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117292  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2024  hypothetical protein  45.33 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.217828  decreased coverage  0.000000018107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  48.05 
 
 		 78 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2136  putative transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3198  hypothetical protein  29.33 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000508147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  35 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1909  putative transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0086  hypothetical protein  29.85 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.417163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0168  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1336  hypothetical protein  28.99 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.94784  normal  0.842689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5711  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 72 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 74 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  30.51 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 71 aa  40.8  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  36.21 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3262  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.941421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 79 aa  40.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  32.2 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  32.76 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  28.81 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  30.51 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  35.59 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8816  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809895  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18370  predicted transcriptional regulator  35.53 
 
 		 78 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.312817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0918  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 72 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>