54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0844 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0844  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 68 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3714  putative transcriptional regulator, XRE family  57.58 
 
 		 70 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3262  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.941421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1655  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1546  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00936975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0370  hypothetical protein  52.46 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2865  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000773901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1528  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000508526  hitchhiker  0.00000000279301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3293  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2426  putative transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1000  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0636  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1108  hypothetical protein  44.62 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.594849  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1465  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2154  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440989  hitchhiker  0.00829248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1464  hypothetical protein  35.38 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0656  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0705  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.45038  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1421  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1909  putative transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386637 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2650  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213866  normal  0.098962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  32.2 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 70 aa  42  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  32.2 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 69 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2988  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.962229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0375  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  35 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  35 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  35 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  35 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  35 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3592  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 74 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>