87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0086 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0086  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.417163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1336  hypothetical protein  65.28 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.94784  normal  0.842689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  38.24 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  44.12 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28080  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00426893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2169  hypothetical protein  45.31 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0666173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0490  hypothetical protein  42.65 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0466  hypothetical protein  42.65 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2300  putative transcriptional regulatory protein  45.31 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1440  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1687  helix-turn-helix type 3  45 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0788  transcriptional regulator, Cro/CI family  41.18 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0484  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05360  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  42.65 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  37.5 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2285  Cro/CI family transcription regulator  42.19 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1909  putative transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3882  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  40.62 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4481  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0478  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1981  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3592  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0918  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1830  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  32.35 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0418  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2988  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.962229 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1958  hypothetical protein  36.51 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2135  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2650  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213866  normal  0.098962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5711  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2426  putative transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0375  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3870  transcriptional regulator, XRE family protein  39.13 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  34.78 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2212  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2707  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4237  putative transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  36.92 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3598  helix-turn-helix type 3  39.13 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0028  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  29.73 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4582  hypothetical protein  33.73 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.804527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0168  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>