More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3078 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  100 
 
 
562 aa  1148    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  34.33 
 
 
642 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  33.44 
 
 
643 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  34.3 
 
 
594 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  34.68 
 
 
630 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  33.79 
 
 
594 aa  274  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.16 
 
 
600 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  33.73 
 
 
599 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  32.65 
 
 
593 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  31.46 
 
 
594 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  32.96 
 
 
579 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  33.62 
 
 
592 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  31.26 
 
 
563 aa  233  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  31.37 
 
 
601 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  31.08 
 
 
565 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  32.03 
 
 
607 aa  226  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  29.69 
 
 
593 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  30.2 
 
 
573 aa  223  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  30.36 
 
 
624 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  32.24 
 
 
601 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  30.28 
 
 
609 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  32.99 
 
 
593 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  30.17 
 
 
570 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.81 
 
 
541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  31.63 
 
 
594 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  29.98 
 
 
570 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  30.35 
 
 
570 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  30.35 
 
 
570 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  30.35 
 
 
570 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  29.8 
 
 
570 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  28.93 
 
 
563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  29.8 
 
 
570 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  29.8 
 
 
545 aa  213  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  29.2 
 
 
565 aa  213  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  29.3 
 
 
570 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  28.89 
 
 
568 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  30.07 
 
 
581 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  30.15 
 
 
586 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  31.61 
 
 
589 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  30.07 
 
 
577 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  30.38 
 
 
575 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  30.58 
 
 
575 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  30.25 
 
 
581 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  32.81 
 
 
597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  29.89 
 
 
580 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  29.89 
 
 
580 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  30.28 
 
 
616 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  29.21 
 
 
613 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  29.89 
 
 
580 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  29.89 
 
 
580 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  31.08 
 
 
580 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  31.06 
 
 
580 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  28.55 
 
 
590 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  31.06 
 
 
580 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  31.56 
 
 
581 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  29.71 
 
 
580 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  30.6 
 
 
578 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  27.13 
 
 
564 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  31.26 
 
 
580 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  31.14 
 
 
575 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  31.06 
 
 
580 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.04 
 
 
527 aa  193  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  29.36 
 
 
576 aa  193  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  30.86 
 
 
578 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  29.59 
 
 
576 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  29.59 
 
 
576 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1522  gamma-glutamyltransferase  31.8 
 
 
589 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  29.53 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2169  gamma-glutamyltransferase  28.1 
 
 
558 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445992  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  30.23 
 
 
606 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  30.98 
 
 
615 aa  189  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  28.15 
 
 
617 aa  187  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  29.87 
 
 
645 aa  187  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  31.9 
 
 
645 aa  187  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  30.63 
 
 
579 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  29.7 
 
 
577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  30.61 
 
 
586 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  27.88 
 
 
581 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  31.93 
 
 
587 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  28.98 
 
 
583 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  29.74 
 
 
581 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 
542 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  28.6 
 
 
604 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  30.04 
 
 
586 aa  181  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  29.86 
 
 
590 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  31.72 
 
 
587 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  32.47 
 
 
601 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  29.32 
 
 
580 aa  179  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  28.72 
 
 
529 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  30.98 
 
 
587 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  29.84 
 
 
587 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  31.21 
 
 
587 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  28.81 
 
 
534 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  28.03 
 
 
599 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  29.52 
 
 
587 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  28.63 
 
 
586 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  29.23 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  29.32 
 
 
586 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  28 
 
 
582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  28.95 
 
 
584 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>